Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQW1

Ykt6, Synaptobrevin homolog YKT6, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ykt6Q9CQW1 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ykt6Q9CQW1 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ykt6Q9CQW1 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ykt6Q9CQW1 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ykt6Q9CQW1 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ykt6Q9CQW1 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ykt6Q9CQW1 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ykt6Q9CQW1 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ykt6Q9CQW1 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Ykt6Q9CQW1 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ykt6Q9CQW1 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ykt6Q9CQW1 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ykt6Q9CQW1 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Ykt6Q9CQW1 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ykt6Q9CQW1 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ykt6Q9CQW1 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ykt6Q9CQW1 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ykt6Q9CQW1 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ykt6Q9CQW1 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ykt6Q9CQW1 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ykt6Q9CQW1 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ykt6Q9CQW1 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ykt6Q9CQW1 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Ykt6Q9CQW1 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ykt6Q9CQW1 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ykt6Q9CQW1 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ykt6Q9CQW1 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ykt6Q9CQW1 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ykt6Q9CQW1 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ykt6Q9CQW1 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ykt6Q9CQW1 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ykt6Q9CQW1 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ykt6Q9CQW1 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ykt6Q9CQW1 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ykt6Q9CQW1 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ykt6Q9CQW1 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ykt6Q9CQW1 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Ykt6Q9CQW1 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ykt6Q9CQW1 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ykt6Q9CQW1 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ykt6Q9CQW1 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ykt6Q9CQW1 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ykt6Q9CQW1 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ykt6Q9CQW1 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ykt6Q9CQW1 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ykt6Q9CQW1 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ykt6Q9CQW1 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ykt6Q9CQW1 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ykt6Q9CQW1 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ykt6Q9CQW1 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ykt6Q9CQW1 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ykt6Q9CQW1 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ykt6Q9CQW1 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ykt6Q9CQW1 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Ykt6Q9CQW1 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ykt6Q9CQW1 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ykt6Q9CQW1 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ykt6Q9CQW1 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ykt6Q9CQW1 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ykt6Q9CQW1 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ykt6Q9CQW1 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ykt6Q9CQW1 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ykt6Q9CQW1 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ykt6Q9CQW1 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ykt6Q9CQW1 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ykt6Q9CQW1 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ykt6Q9CQW1 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ykt6Q9CQW1 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ykt6Q9CQW1 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ykt6Q9CQW1 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ykt6Q9CQW1 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ykt6Q9CQW1 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ykt6Q9CQW1 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Ykt6Q9CQW1 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ykt6Q9CQW1 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ykt6Q9CQW1 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ykt6Q9CQW1 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Ykt6Q9CQW1 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ykt6Q9CQW1 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ykt6Q9CQW1 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ykt6Q9CQW1 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ykt6Q9CQW1 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ykt6Q9CQW1 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ykt6Q9CQW1 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ykt6Q9CQW1 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ykt6Q9CQW1 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ykt6Q9CQW1 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ykt6Q9CQW1 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ykt6Q9CQW1 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ykt6Q9CQW1 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ykt6Q9CQW1 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ykt6Q9CQW1 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Ykt6Q9CQW1 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Ykt6Q9CQW1 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ykt6Q9CQW1 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Ykt6Q9CQW1 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ykt6Q9CQW1 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ykt6Q9CQW1 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ykt6Q9CQW1 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ykt6Q9CQW1 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.4 ms