Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQQ0

Smim8, Small integral membrane protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim8Q9CQQ0 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Smim8Q9CQQ0 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Smim8Q9CQQ0 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Smim8Q9CQQ0 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Smim8Q9CQQ0 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Smim8Q9CQQ0 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Smim8Q9CQQ0 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Smim8Q9CQQ0 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Smim8Q9CQQ0 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Smim8Q9CQQ0 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Smim8Q9CQQ0 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Smim8Q9CQQ0 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Smim8Q9CQQ0 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Smim8Q9CQQ0 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Smim8Q9CQQ0 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Smim8Q9CQQ0 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Smim8Q9CQQ0 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Smim8Q9CQQ0 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Smim8Q9CQQ0 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Smim8Q9CQQ0 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Smim8Q9CQQ0 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Smim8Q9CQQ0 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Smim8Q9CQQ0 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Smim8Q9CQQ0 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Smim8Q9CQQ0 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Smim8Q9CQQ0 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Smim8Q9CQQ0 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Smim8Q9CQQ0 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Smim8Q9CQQ0 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Smim8Q9CQQ0 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Smim8Q9CQQ0 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Smim8Q9CQQ0 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Smim8Q9CQQ0 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Smim8Q9CQQ0 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Smim8Q9CQQ0 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Smim8Q9CQQ0 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Smim8Q9CQQ0 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Smim8Q9CQQ0 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Smim8Q9CQQ0 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Smim8Q9CQQ0 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Smim8Q9CQQ0 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Smim8Q9CQQ0 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Smim8Q9CQQ0 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Smim8Q9CQQ0 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Smim8Q9CQQ0 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Smim8Q9CQQ0 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Smim8Q9CQQ0 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Smim8Q9CQQ0 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Smim8Q9CQQ0 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Smim8Q9CQQ0 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Smim8Q9CQQ0 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Smim8Q9CQQ0 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Smim8Q9CQQ0 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Smim8Q9CQQ0 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Smim8Q9CQQ0 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Smim8Q9CQQ0 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Smim8Q9CQQ0 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Smim8Q9CQQ0 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Smim8Q9CQQ0 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Smim8Q9CQQ0 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Smim8Q9CQQ0 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Smim8Q9CQQ0 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Smim8Q9CQQ0 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Smim8Q9CQQ0 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Smim8Q9CQQ0 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Smim8Q9CQQ0 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Smim8Q9CQQ0 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Smim8Q9CQQ0 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Smim8Q9CQQ0 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Smim8Q9CQQ0 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Smim8Q9CQQ0 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Smim8Q9CQQ0 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Smim8Q9CQQ0 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Smim8Q9CQQ0 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Smim8Q9CQQ0 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Smim8Q9CQQ0 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Smim8Q9CQQ0 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Smim8Q9CQQ0 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Smim8Q9CQQ0 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Smim8Q9CQQ0 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Smim8Q9CQQ0 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Smim8Q9CQQ0 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Smim8Q9CQQ0 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Smim8Q9CQQ0 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Smim8Q9CQQ0 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Smim8Q9CQQ0 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Smim8Q9CQQ0 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Smim8Q9CQQ0 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Smim8Q9CQQ0 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Smim8Q9CQQ0 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Smim8Q9CQQ0 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Smim8Q9CQQ0 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Smim8Q9CQQ0 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Smim8Q9CQQ0 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Smim8Q9CQQ0 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Smim8Q9CQQ0 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Smim8Q9CQQ0 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Smim8Q9CQQ0 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Smim8Q9CQQ0 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Smim8Q9CQQ0 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms