Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQM0

Nicn1, Nicolin-1, mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nicn1Q9CQM0 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Nicn1Q9CQM0 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Nicn1Q9CQM0 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Nicn1Q9CQM0 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Nicn1Q9CQM0 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Nicn1Q9CQM0 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Nicn1Q9CQM0 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Nicn1Q9CQM0 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Nicn1Q9CQM0 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Nicn1Q9CQM0 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Nicn1Q9CQM0 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Nicn1Q9CQM0 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Nicn1Q9CQM0 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Nicn1Q9CQM0 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Nicn1Q9CQM0 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Nicn1Q9CQM0 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Nicn1Q9CQM0 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Nicn1Q9CQM0 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Nicn1Q9CQM0 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Nicn1Q9CQM0 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Nicn1Q9CQM0 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Nicn1Q9CQM0 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Nicn1Q9CQM0 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Nicn1Q9CQM0 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Nicn1Q9CQM0 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Nicn1Q9CQM0 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Nicn1Q9CQM0 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
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Nicn1Q9CQM0 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Nicn1Q9CQM0 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Nicn1Q9CQM0 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Nicn1Q9CQM0 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Nicn1Q9CQM0 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Nicn1Q9CQM0 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Nicn1Q9CQM0 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Nicn1Q9CQM0 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Nicn1Q9CQM0 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Nicn1Q9CQM0 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Nicn1Q9CQM0 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Nicn1Q9CQM0 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Nicn1Q9CQM0 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Nicn1Q9CQM0 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Nicn1Q9CQM0 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Nicn1Q9CQM0 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
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Nicn1Q9CQM0 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Nicn1Q9CQM0 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
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Nicn1Q9CQM0 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Nicn1Q9CQM0 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Nicn1Q9CQM0 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
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Nicn1Q9CQM0 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
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Nicn1Q9CQM0 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Nicn1Q9CQM0 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Nicn1Q9CQM0 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Nicn1Q9CQM0 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Nicn1Q9CQM0 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Nicn1Q9CQM0 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
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Nicn1Q9CQM0 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Nicn1Q9CQM0 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
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Nicn1Q9CQM0 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Nicn1Q9CQM0 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Nicn1Q9CQM0 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Nicn1Q9CQM0 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Nicn1Q9CQM0 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Nicn1Q9CQM0 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nicn1Q9CQM0 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nicn1Q9CQM0 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nicn1Q9CQM0 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
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Nicn1Q9CQM0 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nicn1Q9CQM0 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nicn1Q9CQM0 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nicn1Q9CQM0 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nicn1Q9CQM0 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nicn1Q9CQM0 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nicn1Q9CQM0 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nicn1Q9CQM0 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nicn1Q9CQM0 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nicn1Q9CQM0 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nicn1Q9CQM0 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nicn1Q9CQM0 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Nicn1Q9CQM0 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Nicn1Q9CQM0 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Nicn1Q9CQM0 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Nicn1Q9CQM0 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Nicn1Q9CQM0 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Nicn1Q9CQM0 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Nicn1Q9CQM0 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms