Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQK7

Rwdd1, RWD domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rwdd1Q9CQK7 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rwdd1Q9CQK7 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rwdd1Q9CQK7 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rwdd1Q9CQK7 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rwdd1Q9CQK7 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rwdd1Q9CQK7 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rwdd1Q9CQK7 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rwdd1Q9CQK7 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Rwdd1Q9CQK7 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rwdd1Q9CQK7 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rwdd1Q9CQK7 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rwdd1Q9CQK7 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rwdd1Q9CQK7 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rwdd1Q9CQK7 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rwdd1Q9CQK7 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rwdd1Q9CQK7 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Rwdd1Q9CQK7 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rwdd1Q9CQK7 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rwdd1Q9CQK7 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rwdd1Q9CQK7 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rwdd1Q9CQK7 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rwdd1Q9CQK7 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rwdd1Q9CQK7 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rwdd1Q9CQK7 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rwdd1Q9CQK7 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rwdd1Q9CQK7 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rwdd1Q9CQK7 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rwdd1Q9CQK7 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rwdd1Q9CQK7 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rwdd1Q9CQK7 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rwdd1Q9CQK7 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rwdd1Q9CQK7 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rwdd1Q9CQK7 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rwdd1Q9CQK7 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rwdd1Q9CQK7 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Rwdd1Q9CQK7 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rwdd1Q9CQK7 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rwdd1Q9CQK7 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rwdd1Q9CQK7 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rwdd1Q9CQK7 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rwdd1Q9CQK7 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rwdd1Q9CQK7 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rwdd1Q9CQK7 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rwdd1Q9CQK7 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rwdd1Q9CQK7 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rwdd1Q9CQK7 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rwdd1Q9CQK7 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rwdd1Q9CQK7 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rwdd1Q9CQK7 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rwdd1Q9CQK7 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rwdd1Q9CQK7 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rwdd1Q9CQK7 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rwdd1Q9CQK7 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rwdd1Q9CQK7 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Rwdd1Q9CQK7 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Rwdd1Q9CQK7 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Rwdd1Q9CQK7 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Rwdd1Q9CQK7 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rwdd1Q9CQK7 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rwdd1Q9CQK7 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rwdd1Q9CQK7 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rwdd1Q9CQK7 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rwdd1Q9CQK7 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rwdd1Q9CQK7 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rwdd1Q9CQK7 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rwdd1Q9CQK7 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rwdd1Q9CQK7 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rwdd1Q9CQK7 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rwdd1Q9CQK7 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rwdd1Q9CQK7 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Rwdd1Q9CQK7 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Rwdd1Q9CQK7 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rwdd1Q9CQK7 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rwdd1Q9CQK7 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rwdd1Q9CQK7 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Rwdd1Q9CQK7 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Rwdd1Q9CQK7 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rwdd1Q9CQK7 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rwdd1Q9CQK7 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rwdd1Q9CQK7 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Rwdd1Q9CQK7 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rwdd1Q9CQK7 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rwdd1Q9CQK7 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rwdd1Q9CQK7 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Rwdd1Q9CQK7 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rwdd1Q9CQK7 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rwdd1Q9CQK7 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rwdd1Q9CQK7 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rwdd1Q9CQK7 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rwdd1Q9CQK7 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rwdd1Q9CQK7 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rwdd1Q9CQK7 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rwdd1Q9CQK7 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rwdd1Q9CQK7 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rwdd1Q9CQK7 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rwdd1Q9CQK7 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rwdd1Q9CQK7 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rwdd1Q9CQK7 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rwdd1Q9CQK7 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rwdd1Q9CQK7 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms