Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQK3

Rdm1, RAD52 motif-containing protein 1, mousemouse

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Length 281 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdm1Q9CQK3 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Rdm1Q9CQK3 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Rdm1Q9CQK3 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Rdm1Q9CQK3 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Rdm1Q9CQK3 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Rdm1Q9CQK3 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Rdm1Q9CQK3 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Rdm1Q9CQK3 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Rdm1Q9CQK3 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Rdm1Q9CQK3 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Rdm1Q9CQK3 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Rdm1Q9CQK3 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Rdm1Q9CQK3 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Rdm1Q9CQK3 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Rdm1Q9CQK3 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rdm1Q9CQK3 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rdm1Q9CQK3 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rdm1Q9CQK3 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rdm1Q9CQK3 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rdm1Q9CQK3 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rdm1Q9CQK3 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rdm1Q9CQK3 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rdm1Q9CQK3 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Rdm1Q9CQK3 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rdm1Q9CQK3 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rdm1Q9CQK3 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rdm1Q9CQK3 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rdm1Q9CQK3 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rdm1Q9CQK3 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rdm1Q9CQK3 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rdm1Q9CQK3 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rdm1Q9CQK3 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Rdm1Q9CQK3 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rdm1Q9CQK3 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rdm1Q9CQK3 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rdm1Q9CQK3 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rdm1Q9CQK3 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rdm1Q9CQK3 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Rdm1Q9CQK3 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rdm1Q9CQK3 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rdm1Q9CQK3 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rdm1Q9CQK3 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Rdm1Q9CQK3 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rdm1Q9CQK3 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rdm1Q9CQK3 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rdm1Q9CQK3 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rdm1Q9CQK3 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rdm1Q9CQK3 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rdm1Q9CQK3 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rdm1Q9CQK3 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rdm1Q9CQK3 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rdm1Q9CQK3 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rdm1Q9CQK3 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rdm1Q9CQK3 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rdm1Q9CQK3 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Rdm1Q9CQK3 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rdm1Q9CQK3 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rdm1Q9CQK3 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Rdm1Q9CQK3 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rdm1Q9CQK3 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Rdm1Q9CQK3 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rdm1Q9CQK3 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rdm1Q9CQK3 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rdm1Q9CQK3 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rdm1Q9CQK3 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rdm1Q9CQK3 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Rdm1Q9CQK3 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rdm1Q9CQK3 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rdm1Q9CQK3 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rdm1Q9CQK3 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rdm1Q9CQK3 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Rdm1Q9CQK3 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Rdm1Q9CQK3 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Rdm1Q9CQK3 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Rdm1Q9CQK3 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Rdm1Q9CQK3 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Rdm1Q9CQK3 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Rdm1Q9CQK3 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Rdm1Q9CQK3 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Rdm1Q9CQK3 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Rdm1Q9CQK3 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Rdm1Q9CQK3 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Rdm1Q9CQK3 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Rdm1Q9CQK3 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Rdm1Q9CQK3 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Rdm1Q9CQK3 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Rdm1Q9CQK3 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rdm1Q9CQK3 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rdm1Q9CQK3 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rdm1Q9CQK3 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rdm1Q9CQK3 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rdm1Q9CQK3 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rdm1Q9CQK3 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rdm1Q9CQK3 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rdm1Q9CQK3 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rdm1Q9CQK3 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rdm1Q9CQK3 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rdm1Q9CQK3 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rdm1Q9CQK3 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Rdm1Q9CQK3 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
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