Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQJ8

Ndufb9, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufb9Q9CQJ8 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ndufb9Q9CQJ8 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ndufb9Q9CQJ8 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ndufb9Q9CQJ8 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ndufb9Q9CQJ8 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ndufb9Q9CQJ8 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ndufb9Q9CQJ8 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ndufb9Q9CQJ8 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ndufb9Q9CQJ8 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ndufb9Q9CQJ8 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ndufb9Q9CQJ8 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ndufb9Q9CQJ8 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Ndufb9Q9CQJ8 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ndufb9Q9CQJ8 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ndufb9Q9CQJ8 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ndufb9Q9CQJ8 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ndufb9Q9CQJ8 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Ndufb9Q9CQJ8 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Ndufb9Q9CQJ8 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Ndufb9Q9CQJ8 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ndufb9Q9CQJ8 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ndufb9Q9CQJ8 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Ndufb9Q9CQJ8 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Ndufb9Q9CQJ8 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ndufb9Q9CQJ8 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ndufb9Q9CQJ8 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ndufb9Q9CQJ8 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ndufb9Q9CQJ8 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ndufb9Q9CQJ8 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ndufb9Q9CQJ8 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ndufb9Q9CQJ8 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ndufb9Q9CQJ8 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ndufb9Q9CQJ8 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ndufb9Q9CQJ8 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ndufb9Q9CQJ8 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ndufb9Q9CQJ8 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ndufb9Q9CQJ8 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ndufb9Q9CQJ8 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ndufb9Q9CQJ8 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ndufb9Q9CQJ8 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ndufb9Q9CQJ8 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ndufb9Q9CQJ8 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ndufb9Q9CQJ8 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ndufb9Q9CQJ8 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ndufb9Q9CQJ8 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ndufb9Q9CQJ8 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Ndufb9Q9CQJ8 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ndufb9Q9CQJ8 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ndufb9Q9CQJ8 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ndufb9Q9CQJ8 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ndufb9Q9CQJ8 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ndufb9Q9CQJ8 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ndufb9Q9CQJ8 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ndufb9Q9CQJ8 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Ndufb9Q9CQJ8 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ndufb9Q9CQJ8 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ndufb9Q9CQJ8 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Ndufb9Q9CQJ8 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Ndufb9Q9CQJ8 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Ndufb9Q9CQJ8 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Ndufb9Q9CQJ8 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Ndufb9Q9CQJ8 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Ndufb9Q9CQJ8 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Ndufb9Q9CQJ8 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Ndufb9Q9CQJ8 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ndufb9Q9CQJ8 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ndufb9Q9CQJ8 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ndufb9Q9CQJ8 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ndufb9Q9CQJ8 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Ndufb9Q9CQJ8 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ndufb9Q9CQJ8 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ndufb9Q9CQJ8 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ndufb9Q9CQJ8 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ndufb9Q9CQJ8 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ndufb9Q9CQJ8 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ndufb9Q9CQJ8 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ndufb9Q9CQJ8 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ndufb9Q9CQJ8 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ndufb9Q9CQJ8 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ndufb9Q9CQJ8 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Ndufb9Q9CQJ8 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ndufb9Q9CQJ8 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ndufb9Q9CQJ8 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ndufb9Q9CQJ8 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ndufb9Q9CQJ8 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ndufb9Q9CQJ8 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ndufb9Q9CQJ8 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ndufb9Q9CQJ8 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ndufb9Q9CQJ8 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ndufb9Q9CQJ8 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ndufb9Q9CQJ8 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ndufb9Q9CQJ8 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ndufb9Q9CQJ8 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ndufb9Q9CQJ8 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ndufb9Q9CQJ8 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ndufb9Q9CQJ8 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ndufb9Q9CQJ8 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ndufb9Q9CQJ8 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Ndufb9Q9CQJ8 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ndufb9Q9CQJ8 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms