Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQJ1

Higd2a, HIG1 domain family member 2A, mousemouse

Predictions only

Length 106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Higd2aQ9CQJ1 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Higd2aQ9CQJ1 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Higd2aQ9CQJ1 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Higd2aQ9CQJ1 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Higd2aQ9CQJ1 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Higd2aQ9CQJ1 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Higd2aQ9CQJ1 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Higd2aQ9CQJ1 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Higd2aQ9CQJ1 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Higd2aQ9CQJ1 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Higd2aQ9CQJ1 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Higd2aQ9CQJ1 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Higd2aQ9CQJ1 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Higd2aQ9CQJ1 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Higd2aQ9CQJ1 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Higd2aQ9CQJ1 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Higd2aQ9CQJ1 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Higd2aQ9CQJ1 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Higd2aQ9CQJ1 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Higd2aQ9CQJ1 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Higd2aQ9CQJ1 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Higd2aQ9CQJ1 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Higd2aQ9CQJ1 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Higd2aQ9CQJ1 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Higd2aQ9CQJ1 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Higd2aQ9CQJ1 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Higd2aQ9CQJ1 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Higd2aQ9CQJ1 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Higd2aQ9CQJ1 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Higd2aQ9CQJ1 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Higd2aQ9CQJ1 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Higd2aQ9CQJ1 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Higd2aQ9CQJ1 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Higd2aQ9CQJ1 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Higd2aQ9CQJ1 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Higd2aQ9CQJ1 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Higd2aQ9CQJ1 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Higd2aQ9CQJ1 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Higd2aQ9CQJ1 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Higd2aQ9CQJ1 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Higd2aQ9CQJ1 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Higd2aQ9CQJ1 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Higd2aQ9CQJ1 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Higd2aQ9CQJ1 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Higd2aQ9CQJ1 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Higd2aQ9CQJ1 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Higd2aQ9CQJ1 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Higd2aQ9CQJ1 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Higd2aQ9CQJ1 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Higd2aQ9CQJ1 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Higd2aQ9CQJ1 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Higd2aQ9CQJ1 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Higd2aQ9CQJ1 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Higd2aQ9CQJ1 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Higd2aQ9CQJ1 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Higd2aQ9CQJ1 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Higd2aQ9CQJ1 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Higd2aQ9CQJ1 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Higd2aQ9CQJ1 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Higd2aQ9CQJ1 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Higd2aQ9CQJ1 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Higd2aQ9CQJ1 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Higd2aQ9CQJ1 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Higd2aQ9CQJ1 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Higd2aQ9CQJ1 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Higd2aQ9CQJ1 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Higd2aQ9CQJ1 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Higd2aQ9CQJ1 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Higd2aQ9CQJ1 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Higd2aQ9CQJ1 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Higd2aQ9CQJ1 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Higd2aQ9CQJ1 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Higd2aQ9CQJ1 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Higd2aQ9CQJ1 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Higd2aQ9CQJ1 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Higd2aQ9CQJ1 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Higd2aQ9CQJ1 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Higd2aQ9CQJ1 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Higd2aQ9CQJ1 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Higd2aQ9CQJ1 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Higd2aQ9CQJ1 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Higd2aQ9CQJ1 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Higd2aQ9CQJ1 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Higd2aQ9CQJ1 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Higd2aQ9CQJ1 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Higd2aQ9CQJ1 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Higd2aQ9CQJ1 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Higd2aQ9CQJ1 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Higd2aQ9CQJ1 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Higd2aQ9CQJ1 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Higd2aQ9CQJ1 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Higd2aQ9CQJ1 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Higd2aQ9CQJ1 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Higd2aQ9CQJ1 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Higd2aQ9CQJ1 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Higd2aQ9CQJ1 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Higd2aQ9CQJ1 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Higd2aQ9CQJ1 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Higd2aQ9CQJ1 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Higd2aQ9CQJ1 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms