Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQF3

Nudt21, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nudt21Q9CQF3 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nudt21Q9CQF3 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nudt21Q9CQF3 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nudt21Q9CQF3 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nudt21Q9CQF3 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Nudt21Q9CQF3 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nudt21Q9CQF3 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nudt21Q9CQF3 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Nudt21Q9CQF3 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nudt21Q9CQF3 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nudt21Q9CQF3 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nudt21Q9CQF3 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nudt21Q9CQF3 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nudt21Q9CQF3 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nudt21Q9CQF3 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nudt21Q9CQF3 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nudt21Q9CQF3 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nudt21Q9CQF3 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nudt21Q9CQF3 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nudt21Q9CQF3 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nudt21Q9CQF3 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nudt21Q9CQF3 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nudt21Q9CQF3 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nudt21Q9CQF3 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nudt21Q9CQF3 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nudt21Q9CQF3 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nudt21Q9CQF3 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nudt21Q9CQF3 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nudt21Q9CQF3 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nudt21Q9CQF3 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nudt21Q9CQF3 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nudt21Q9CQF3 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Nudt21Q9CQF3 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nudt21Q9CQF3 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nudt21Q9CQF3 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nudt21Q9CQF3 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nudt21Q9CQF3 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nudt21Q9CQF3 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nudt21Q9CQF3 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nudt21Q9CQF3 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nudt21Q9CQF3 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nudt21Q9CQF3 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nudt21Q9CQF3 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nudt21Q9CQF3 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nudt21Q9CQF3 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nudt21Q9CQF3 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nudt21Q9CQF3 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nudt21Q9CQF3 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Nudt21Q9CQF3 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nudt21Q9CQF3 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nudt21Q9CQF3 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nudt21Q9CQF3 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nudt21Q9CQF3 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nudt21Q9CQF3 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nudt21Q9CQF3 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Nudt21Q9CQF3 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nudt21Q9CQF3 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nudt21Q9CQF3 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nudt21Q9CQF3 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Nudt21Q9CQF3 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nudt21Q9CQF3 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nudt21Q9CQF3 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nudt21Q9CQF3 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nudt21Q9CQF3 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nudt21Q9CQF3 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nudt21Q9CQF3 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nudt21Q9CQF3 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nudt21Q9CQF3 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nudt21Q9CQF3 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nudt21Q9CQF3 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nudt21Q9CQF3 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nudt21Q9CQF3 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nudt21Q9CQF3 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nudt21Q9CQF3 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nudt21Q9CQF3 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nudt21Q9CQF3 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nudt21Q9CQF3 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nudt21Q9CQF3 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nudt21Q9CQF3 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nudt21Q9CQF3 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Nudt21Q9CQF3 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nudt21Q9CQF3 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nudt21Q9CQF3 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nudt21Q9CQF3 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nudt21Q9CQF3 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nudt21Q9CQF3 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nudt21Q9CQF3 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nudt21Q9CQF3 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nudt21Q9CQF3 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nudt21Q9CQF3 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nudt21Q9CQF3 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nudt21Q9CQF3 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nudt21Q9CQF3 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nudt21Q9CQF3 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nudt21Q9CQF3 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nudt21Q9CQF3 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Nudt21Q9CQF3 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nudt21Q9CQF3 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nudt21Q9CQF3 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nudt21Q9CQF3 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms