Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQA1

Trappc5, Trafficking protein particle complex subunit 5, mousemouse

Predictions only

Length 188 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc5Q9CQA1 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Trappc5Q9CQA1 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trappc5Q9CQA1 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trappc5Q9CQA1 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trappc5Q9CQA1 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trappc5Q9CQA1 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trappc5Q9CQA1 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trappc5Q9CQA1 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Trappc5Q9CQA1 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trappc5Q9CQA1 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trappc5Q9CQA1 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trappc5Q9CQA1 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trappc5Q9CQA1 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trappc5Q9CQA1 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trappc5Q9CQA1 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trappc5Q9CQA1 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trappc5Q9CQA1 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trappc5Q9CQA1 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trappc5Q9CQA1 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trappc5Q9CQA1 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trappc5Q9CQA1 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trappc5Q9CQA1 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trappc5Q9CQA1 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trappc5Q9CQA1 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trappc5Q9CQA1 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trappc5Q9CQA1 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trappc5Q9CQA1 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trappc5Q9CQA1 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trappc5Q9CQA1 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trappc5Q9CQA1 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trappc5Q9CQA1 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trappc5Q9CQA1 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trappc5Q9CQA1 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trappc5Q9CQA1 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trappc5Q9CQA1 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Trappc5Q9CQA1 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trappc5Q9CQA1 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trappc5Q9CQA1 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trappc5Q9CQA1 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trappc5Q9CQA1 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trappc5Q9CQA1 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trappc5Q9CQA1 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trappc5Q9CQA1 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trappc5Q9CQA1 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trappc5Q9CQA1 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trappc5Q9CQA1 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trappc5Q9CQA1 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trappc5Q9CQA1 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trappc5Q9CQA1 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Trappc5Q9CQA1 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Trappc5Q9CQA1 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Trappc5Q9CQA1 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Trappc5Q9CQA1 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Trappc5Q9CQA1 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Trappc5Q9CQA1 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Trappc5Q9CQA1 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
Trappc5Q9CQA1 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trappc5Q9CQA1 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trappc5Q9CQA1 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trappc5Q9CQA1 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trappc5Q9CQA1 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trappc5Q9CQA1 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trappc5Q9CQA1 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trappc5Q9CQA1 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trappc5Q9CQA1 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trappc5Q9CQA1 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Trappc5Q9CQA1 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trappc5Q9CQA1 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trappc5Q9CQA1 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trappc5Q9CQA1 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trappc5Q9CQA1 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trappc5Q9CQA1 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trappc5Q9CQA1 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trappc5Q9CQA1 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trappc5Q9CQA1 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trappc5Q9CQA1 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trappc5Q9CQA1 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trappc5Q9CQA1 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trappc5Q9CQA1 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trappc5Q9CQA1 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trappc5Q9CQA1 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trappc5Q9CQA1 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Trappc5Q9CQA1 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trappc5Q9CQA1 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Trappc5Q9CQA1 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trappc5Q9CQA1 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trappc5Q9CQA1 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trappc5Q9CQA1 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trappc5Q9CQA1 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trappc5Q9CQA1 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Trappc5Q9CQA1 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trappc5Q9CQA1 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trappc5Q9CQA1 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trappc5Q9CQA1 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trappc5Q9CQA1 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Trappc5Q9CQA1 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Trappc5Q9CQA1 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Trappc5Q9CQA1 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Trappc5Q9CQA1 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Trappc5Q9CQA1 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms