Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ85

Timm22, Mitochondrial import inner membrane translocase subunit Tim22, mousemouse

Predictions only

Length 194 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Timm22Q9CQ85 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Timm22Q9CQ85 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Timm22Q9CQ85 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Timm22Q9CQ85 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Timm22Q9CQ85 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Timm22Q9CQ85 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Timm22Q9CQ85 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Timm22Q9CQ85 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Timm22Q9CQ85 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Timm22Q9CQ85 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Timm22Q9CQ85 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Timm22Q9CQ85 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Timm22Q9CQ85 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Timm22Q9CQ85 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Timm22Q9CQ85 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Timm22Q9CQ85 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Timm22Q9CQ85 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Timm22Q9CQ85 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Timm22Q9CQ85 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Timm22Q9CQ85 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Timm22Q9CQ85 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Timm22Q9CQ85 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Timm22Q9CQ85 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Timm22Q9CQ85 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Timm22Q9CQ85 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Timm22Q9CQ85 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Timm22Q9CQ85 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Timm22Q9CQ85 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Timm22Q9CQ85 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Timm22Q9CQ85 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Timm22Q9CQ85 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Timm22Q9CQ85 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Timm22Q9CQ85 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Timm22Q9CQ85 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Timm22Q9CQ85 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Timm22Q9CQ85 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Timm22Q9CQ85 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Timm22Q9CQ85 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Timm22Q9CQ85 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Timm22Q9CQ85 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Timm22Q9CQ85 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Timm22Q9CQ85 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Timm22Q9CQ85 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Timm22Q9CQ85 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Timm22Q9CQ85 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Timm22Q9CQ85 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Timm22Q9CQ85 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Timm22Q9CQ85 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Timm22Q9CQ85 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Timm22Q9CQ85 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Timm22Q9CQ85 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Timm22Q9CQ85 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Timm22Q9CQ85 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Timm22Q9CQ85 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Timm22Q9CQ85 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Timm22Q9CQ85 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Timm22Q9CQ85 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Timm22Q9CQ85 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Timm22Q9CQ85 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Timm22Q9CQ85 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Timm22Q9CQ85 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Timm22Q9CQ85 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Timm22Q9CQ85 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Timm22Q9CQ85 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Timm22Q9CQ85 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Timm22Q9CQ85 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Timm22Q9CQ85 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Timm22Q9CQ85 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Timm22Q9CQ85 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Timm22Q9CQ85 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Timm22Q9CQ85 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Timm22Q9CQ85 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Timm22Q9CQ85 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Timm22Q9CQ85 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Timm22Q9CQ85 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Timm22Q9CQ85 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Timm22Q9CQ85 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Timm22Q9CQ85 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Timm22Q9CQ85 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Timm22Q9CQ85 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Timm22Q9CQ85 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Timm22Q9CQ85 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Timm22Q9CQ85 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Timm22Q9CQ85 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Timm22Q9CQ85 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Timm22Q9CQ85 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Timm22Q9CQ85 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Timm22Q9CQ85 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Timm22Q9CQ85 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Timm22Q9CQ85 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Timm22Q9CQ85 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Timm22Q9CQ85 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Timm22Q9CQ85 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Timm22Q9CQ85 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Timm22Q9CQ85 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Timm22Q9CQ85 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Timm22Q9CQ85 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Timm22Q9CQ85 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Timm22Q9CQ85 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Timm22Q9CQ85 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms