Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ84

Ubl4b, Ubiquitin-like protein 4B, mousemouse

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubl4bQ9CQ84 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Ubl4bQ9CQ84 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Ubl4bQ9CQ84 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Ubl4bQ9CQ84 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
Ubl4bQ9CQ84 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Ubl4bQ9CQ84 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Ubl4bQ9CQ84 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Ubl4bQ9CQ84 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Ubl4bQ9CQ84 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Ubl4bQ9CQ84 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Ubl4bQ9CQ84 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Ubl4bQ9CQ84 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
Ubl4bQ9CQ84 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Ubl4bQ9CQ84 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Ubl4bQ9CQ84 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Ubl4bQ9CQ84 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Ubl4bQ9CQ84 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Ubl4bQ9CQ84 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Ubl4bQ9CQ84 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Ubl4bQ9CQ84 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Ubl4bQ9CQ84 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Ubl4bQ9CQ84 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Ubl4bQ9CQ84 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Ubl4bQ9CQ84 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Ubl4bQ9CQ84 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Ubl4bQ9CQ84 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Ubl4bQ9CQ84 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Ubl4bQ9CQ84 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Ubl4bQ9CQ84 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Ubl4bQ9CQ84 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
Ubl4bQ9CQ84 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Ubl4bQ9CQ84 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Ubl4bQ9CQ84 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Ubl4bQ9CQ84 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Ubl4bQ9CQ84 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
Ubl4bQ9CQ84 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Ubl4bQ9CQ84 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Ubl4bQ9CQ84 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
Ubl4bQ9CQ84 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
Ubl4bQ9CQ84 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Ubl4bQ9CQ84 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Ubl4bQ9CQ84 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Ubl4bQ9CQ84 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Ubl4bQ9CQ84 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Ubl4bQ9CQ84 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Ubl4bQ9CQ84 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Ubl4bQ9CQ84 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Ubl4bQ9CQ84 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Ubl4bQ9CQ84 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Ubl4bQ9CQ84 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Ubl4bQ9CQ84 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Ubl4bQ9CQ84 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
Ubl4bQ9CQ84 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Ubl4bQ9CQ84 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Ubl4bQ9CQ84 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Ubl4bQ9CQ84 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Ubl4bQ9CQ84 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Ubl4bQ9CQ84 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Ubl4bQ9CQ84 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
Ubl4bQ9CQ84 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Ubl4bQ9CQ84 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Ubl4bQ9CQ84 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Ubl4bQ9CQ84 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Ubl4bQ9CQ84 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Ubl4bQ9CQ84 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Ubl4bQ9CQ84 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Ubl4bQ9CQ84 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
Ubl4bQ9CQ84 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Ubl4bQ9CQ84 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Ubl4bQ9CQ84 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Ubl4bQ9CQ84 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Ubl4bQ9CQ84 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Ubl4bQ9CQ84 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Ubl4bQ9CQ84 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Ubl4bQ9CQ84 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Ubl4bQ9CQ84 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Ubl4bQ9CQ84 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Ubl4bQ9CQ84 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Ubl4bQ9CQ84 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Ubl4bQ9CQ84 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Ubl4bQ9CQ84 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Ubl4bQ9CQ84 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Ubl4bQ9CQ84 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
Ubl4bQ9CQ84 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Ubl4bQ9CQ84 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
Ubl4bQ9CQ84 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Ubl4bQ9CQ84 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
Ubl4bQ9CQ84 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Ubl4bQ9CQ84 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Ubl4bQ9CQ84 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Ubl4bQ9CQ84 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Ubl4bQ9CQ84 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Ubl4bQ9CQ84 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Ubl4bQ9CQ84 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Ubl4bQ9CQ84 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Ubl4bQ9CQ84 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Ubl4bQ9CQ84 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Ubl4bQ9CQ84 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Ubl4bQ9CQ84 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
Ubl4bQ9CQ84 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms