Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ82

Itgb3bp, Centromere protein R, mousemouse

Predictions only

Length 176 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb3bpQ9CQ82 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Itgb3bpQ9CQ82 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Itgb3bpQ9CQ82 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Itgb3bpQ9CQ82 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Itgb3bpQ9CQ82 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Itgb3bpQ9CQ82 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Itgb3bpQ9CQ82 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Itgb3bpQ9CQ82 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Itgb3bpQ9CQ82 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Itgb3bpQ9CQ82 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Itgb3bpQ9CQ82 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Itgb3bpQ9CQ82 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Itgb3bpQ9CQ82 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Itgb3bpQ9CQ82 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Itgb3bpQ9CQ82 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Itgb3bpQ9CQ82 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Itgb3bpQ9CQ82 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Itgb3bpQ9CQ82 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Itgb3bpQ9CQ82 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Itgb3bpQ9CQ82 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Itgb3bpQ9CQ82 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Itgb3bpQ9CQ82 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Itgb3bpQ9CQ82 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Itgb3bpQ9CQ82 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Itgb3bpQ9CQ82 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Itgb3bpQ9CQ82 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Itgb3bpQ9CQ82 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Itgb3bpQ9CQ82 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Itgb3bpQ9CQ82 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Itgb3bpQ9CQ82 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Itgb3bpQ9CQ82 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Itgb3bpQ9CQ82 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Itgb3bpQ9CQ82 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Itgb3bpQ9CQ82 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Itgb3bpQ9CQ82 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Itgb3bpQ9CQ82 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Itgb3bpQ9CQ82 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Itgb3bpQ9CQ82 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Itgb3bpQ9CQ82 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Itgb3bpQ9CQ82 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Itgb3bpQ9CQ82 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Itgb3bpQ9CQ82 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Itgb3bpQ9CQ82 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Itgb3bpQ9CQ82 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Itgb3bpQ9CQ82 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Itgb3bpQ9CQ82 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Itgb3bpQ9CQ82 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Itgb3bpQ9CQ82 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Itgb3bpQ9CQ82 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Itgb3bpQ9CQ82 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Itgb3bpQ9CQ82 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Itgb3bpQ9CQ82 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Itgb3bpQ9CQ82 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Itgb3bpQ9CQ82 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Itgb3bpQ9CQ82 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Itgb3bpQ9CQ82 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Itgb3bpQ9CQ82 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Itgb3bpQ9CQ82 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Itgb3bpQ9CQ82 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Itgb3bpQ9CQ82 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Itgb3bpQ9CQ82 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Itgb3bpQ9CQ82 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Itgb3bpQ9CQ82 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Itgb3bpQ9CQ82 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Itgb3bpQ9CQ82 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Itgb3bpQ9CQ82 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Itgb3bpQ9CQ82 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Itgb3bpQ9CQ82 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Itgb3bpQ9CQ82 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Itgb3bpQ9CQ82 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Itgb3bpQ9CQ82 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Itgb3bpQ9CQ82 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Itgb3bpQ9CQ82 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Itgb3bpQ9CQ82 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Itgb3bpQ9CQ82 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Itgb3bpQ9CQ82 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Itgb3bpQ9CQ82 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Itgb3bpQ9CQ82 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Itgb3bpQ9CQ82 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Itgb3bpQ9CQ82 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Itgb3bpQ9CQ82 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Itgb3bpQ9CQ82 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Itgb3bpQ9CQ82 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Itgb3bpQ9CQ82 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Itgb3bpQ9CQ82 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Itgb3bpQ9CQ82 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Itgb3bpQ9CQ82 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Itgb3bpQ9CQ82 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Itgb3bpQ9CQ82 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Itgb3bpQ9CQ82 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Itgb3bpQ9CQ82 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Itgb3bpQ9CQ82 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Itgb3bpQ9CQ82 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Itgb3bpQ9CQ82 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Itgb3bpQ9CQ82 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Itgb3bpQ9CQ82 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Itgb3bpQ9CQ82 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Itgb3bpQ9CQ82 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Itgb3bpQ9CQ82 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Itgb3bpQ9CQ82 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms