Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ47

4921530L21Rik, RIKEN cDNA 4921530L21 gene, mousemouse

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4921530L21RikQ9CQ47 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
4921530L21RikQ9CQ47 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
4921530L21RikQ9CQ47 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
4921530L21RikQ9CQ47 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
4921530L21RikQ9CQ47 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
4921530L21RikQ9CQ47 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
4921530L21RikQ9CQ47 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
4921530L21RikQ9CQ47 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
4921530L21RikQ9CQ47 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
4921530L21RikQ9CQ47 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
4921530L21RikQ9CQ47 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
4921530L21RikQ9CQ47 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
4921530L21RikQ9CQ47 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
4921530L21RikQ9CQ47 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
4921530L21RikQ9CQ47 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
4921530L21RikQ9CQ47 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
4921530L21RikQ9CQ47 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
4921530L21RikQ9CQ47 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
4921530L21RikQ9CQ47 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
4921530L21RikQ9CQ47 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
4921530L21RikQ9CQ47 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
4921530L21RikQ9CQ47 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
4921530L21RikQ9CQ47 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
4921530L21RikQ9CQ47 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
4921530L21RikQ9CQ47 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
4921530L21RikQ9CQ47 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
4921530L21RikQ9CQ47 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
4921530L21RikQ9CQ47 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
4921530L21RikQ9CQ47 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
4921530L21RikQ9CQ47 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
4921530L21RikQ9CQ47 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
4921530L21RikQ9CQ47 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
4921530L21RikQ9CQ47 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
4921530L21RikQ9CQ47 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
4921530L21RikQ9CQ47 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
4921530L21RikQ9CQ47 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
4921530L21RikQ9CQ47 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
4921530L21RikQ9CQ47 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
4921530L21RikQ9CQ47 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
4921530L21RikQ9CQ47 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
4921530L21RikQ9CQ47 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
4921530L21RikQ9CQ47 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
4921530L21RikQ9CQ47 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
4921530L21RikQ9CQ47 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
4921530L21RikQ9CQ47 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
4921530L21RikQ9CQ47 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
4921530L21RikQ9CQ47 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
4921530L21RikQ9CQ47 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
4921530L21RikQ9CQ47 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
4921530L21RikQ9CQ47 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
4921530L21RikQ9CQ47 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
4921530L21RikQ9CQ47 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
4921530L21RikQ9CQ47 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
4921530L21RikQ9CQ47 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
4921530L21RikQ9CQ47 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
4921530L21RikQ9CQ47 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
4921530L21RikQ9CQ47 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
4921530L21RikQ9CQ47 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
4921530L21RikQ9CQ47 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
4921530L21RikQ9CQ47 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
4921530L21RikQ9CQ47 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
4921530L21RikQ9CQ47 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
4921530L21RikQ9CQ47 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
4921530L21RikQ9CQ47 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
4921530L21RikQ9CQ47 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
4921530L21RikQ9CQ47 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
4921530L21RikQ9CQ47 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
4921530L21RikQ9CQ47 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
4921530L21RikQ9CQ47 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
4921530L21RikQ9CQ47 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
4921530L21RikQ9CQ47 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
4921530L21RikQ9CQ47 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
4921530L21RikQ9CQ47 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
4921530L21RikQ9CQ47 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
4921530L21RikQ9CQ47 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
4921530L21RikQ9CQ47 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
4921530L21RikQ9CQ47 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
4921530L21RikQ9CQ47 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
4921530L21RikQ9CQ47 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
4921530L21RikQ9CQ47 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
4921530L21RikQ9CQ47 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
4921530L21RikQ9CQ47 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
4921530L21RikQ9CQ47 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
4921530L21RikQ9CQ47 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
4921530L21RikQ9CQ47 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
4921530L21RikQ9CQ47 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
4921530L21RikQ9CQ47 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
4921530L21RikQ9CQ47 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
4921530L21RikQ9CQ47 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
4921530L21RikQ9CQ47 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
4921530L21RikQ9CQ47 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
4921530L21RikQ9CQ47 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
4921530L21RikQ9CQ47 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
4921530L21RikQ9CQ47 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
4921530L21RikQ9CQ47 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
4921530L21RikQ9CQ47 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
4921530L21RikQ9CQ47 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
4921530L21RikQ9CQ47 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
4921530L21RikQ9CQ47 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
4921530L21RikQ9CQ47 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms