Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPX6

Atg3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg3Q9CPX6 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Atg3Q9CPX6 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Atg3Q9CPX6 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Atg3Q9CPX6 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Atg3Q9CPX6 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Atg3Q9CPX6 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Atg3Q9CPX6 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Atg3Q9CPX6 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Atg3Q9CPX6 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Atg3Q9CPX6 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Atg3Q9CPX6 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Atg3Q9CPX6 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Atg3Q9CPX6 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Atg3Q9CPX6 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Atg3Q9CPX6 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Atg3Q9CPX6 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Atg3Q9CPX6 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Atg3Q9CPX6 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Atg3Q9CPX6 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Atg3Q9CPX6 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Atg3Q9CPX6 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Atg3Q9CPX6 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Atg3Q9CPX6 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Atg3Q9CPX6 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Atg3Q9CPX6 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Atg3Q9CPX6 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Atg3Q9CPX6 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Atg3Q9CPX6 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Atg3Q9CPX6 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Atg3Q9CPX6 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Atg3Q9CPX6 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Atg3Q9CPX6 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Atg3Q9CPX6 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Atg3Q9CPX6 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Atg3Q9CPX6 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Atg3Q9CPX6 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Atg3Q9CPX6 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Atg3Q9CPX6 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Atg3Q9CPX6 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Atg3Q9CPX6 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Atg3Q9CPX6 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Atg3Q9CPX6 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Atg3Q9CPX6 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Atg3Q9CPX6 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Atg3Q9CPX6 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Atg3Q9CPX6 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Atg3Q9CPX6 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Atg3Q9CPX6 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Atg3Q9CPX6 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Atg3Q9CPX6 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Atg3Q9CPX6 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Atg3Q9CPX6 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Atg3Q9CPX6 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Atg3Q9CPX6 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Atg3Q9CPX6 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Atg3Q9CPX6 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Atg3Q9CPX6 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Atg3Q9CPX6 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Atg3Q9CPX6 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Atg3Q9CPX6 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Atg3Q9CPX6 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Atg3Q9CPX6 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Atg3Q9CPX6 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Atg3Q9CPX6 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Atg3Q9CPX6 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Atg3Q9CPX6 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Atg3Q9CPX6 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Atg3Q9CPX6 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Atg3Q9CPX6 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Atg3Q9CPX6 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Atg3Q9CPX6 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Atg3Q9CPX6 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Atg3Q9CPX6 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Atg3Q9CPX6 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Atg3Q9CPX6 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Atg3Q9CPX6 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Atg3Q9CPX6 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Atg3Q9CPX6 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Atg3Q9CPX6 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Atg3Q9CPX6 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Atg3Q9CPX6 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Atg3Q9CPX6 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Atg3Q9CPX6 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Atg3Q9CPX6 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Atg3Q9CPX6 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Atg3Q9CPX6 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Atg3Q9CPX6 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Atg3Q9CPX6 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Atg3Q9CPX6 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Atg3Q9CPX6 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Atg3Q9CPX6 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Atg3Q9CPX6 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Atg3Q9CPX6 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Atg3Q9CPX6 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Atg3Q9CPX6 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Atg3Q9CPX6 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Atg3Q9CPX6 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Atg3Q9CPX6 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Atg3Q9CPX6 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Atg3Q9CPX6 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms