Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPR4

Rpl17, 60S ribosomal protein L17, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 184 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl17Q9CPR4 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rpl17Q9CPR4 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rpl17Q9CPR4 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rpl17Q9CPR4 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rpl17Q9CPR4 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rpl17Q9CPR4 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rpl17Q9CPR4 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rpl17Q9CPR4 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rpl17Q9CPR4 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rpl17Q9CPR4 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rpl17Q9CPR4 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rpl17Q9CPR4 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rpl17Q9CPR4 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rpl17Q9CPR4 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rpl17Q9CPR4 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rpl17Q9CPR4 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rpl17Q9CPR4 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rpl17Q9CPR4 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rpl17Q9CPR4 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rpl17Q9CPR4 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rpl17Q9CPR4 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rpl17Q9CPR4 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rpl17Q9CPR4 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rpl17Q9CPR4 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Rpl17Q9CPR4 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rpl17Q9CPR4 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Rpl17Q9CPR4 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Rpl17Q9CPR4 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Rpl17Q9CPR4 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rpl17Q9CPR4 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rpl17Q9CPR4 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rpl17Q9CPR4 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rpl17Q9CPR4 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rpl17Q9CPR4 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rpl17Q9CPR4 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rpl17Q9CPR4 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rpl17Q9CPR4 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rpl17Q9CPR4 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rpl17Q9CPR4 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rpl17Q9CPR4 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rpl17Q9CPR4 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rpl17Q9CPR4 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rpl17Q9CPR4 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rpl17Q9CPR4 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rpl17Q9CPR4 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rpl17Q9CPR4 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rpl17Q9CPR4 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rpl17Q9CPR4 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rpl17Q9CPR4 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rpl17Q9CPR4 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rpl17Q9CPR4 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rpl17Q9CPR4 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rpl17Q9CPR4 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Rpl17Q9CPR4 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rpl17Q9CPR4 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rpl17Q9CPR4 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rpl17Q9CPR4 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rpl17Q9CPR4 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rpl17Q9CPR4 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rpl17Q9CPR4 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rpl17Q9CPR4 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rpl17Q9CPR4 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rpl17Q9CPR4 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rpl17Q9CPR4 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rpl17Q9CPR4 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rpl17Q9CPR4 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rpl17Q9CPR4 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rpl17Q9CPR4 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rpl17Q9CPR4 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rpl17Q9CPR4 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rpl17Q9CPR4 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rpl17Q9CPR4 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Rpl17Q9CPR4 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rpl17Q9CPR4 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rpl17Q9CPR4 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rpl17Q9CPR4 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Rpl17Q9CPR4 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Rpl17Q9CPR4 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rpl17Q9CPR4 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rpl17Q9CPR4 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Rpl17Q9CPR4 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rpl17Q9CPR4 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rpl17Q9CPR4 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rpl17Q9CPR4 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rpl17Q9CPR4 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rpl17Q9CPR4 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rpl17Q9CPR4 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rpl17Q9CPR4 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rpl17Q9CPR4 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rpl17Q9CPR4 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rpl17Q9CPR4 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rpl17Q9CPR4 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rpl17Q9CPR4 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rpl17Q9CPR4 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rpl17Q9CPR4 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rpl17Q9CPR4 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Rpl17Q9CPR4 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rpl17Q9CPR4 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rpl17Q9CPR4 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rpl17Q9CPR4 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms