Protein–RNA interactions for Protein: Q99PV5

Bhlhe41, Class E basic helix-loop-helix protein 41, mousemouse

Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlhe41Q99PV5 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Bhlhe41Q99PV5 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Bhlhe41Q99PV5 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Bhlhe41Q99PV5 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Bhlhe41Q99PV5 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Bhlhe41Q99PV5 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Bhlhe41Q99PV5 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Bhlhe41Q99PV5 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Bhlhe41Q99PV5 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Bhlhe41Q99PV5 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Bhlhe41Q99PV5 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Bhlhe41Q99PV5 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Bhlhe41Q99PV5 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Bhlhe41Q99PV5 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Bhlhe41Q99PV5 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Bhlhe41Q99PV5 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Bhlhe41Q99PV5 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Bhlhe41Q99PV5 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Bhlhe41Q99PV5 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Bhlhe41Q99PV5 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Bhlhe41Q99PV5 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Bhlhe41Q99PV5 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Bhlhe41Q99PV5 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Bhlhe41Q99PV5 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Bhlhe41Q99PV5 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Bhlhe41Q99PV5 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Bhlhe41Q99PV5 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Bhlhe41Q99PV5 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Bhlhe41Q99PV5 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Bhlhe41Q99PV5 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Bhlhe41Q99PV5 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Bhlhe41Q99PV5 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Bhlhe41Q99PV5 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Bhlhe41Q99PV5 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Bhlhe41Q99PV5 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Bhlhe41Q99PV5 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Bhlhe41Q99PV5 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Bhlhe41Q99PV5 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Bhlhe41Q99PV5 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Bhlhe41Q99PV5 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Bhlhe41Q99PV5 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Bhlhe41Q99PV5 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Bhlhe41Q99PV5 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Bhlhe41Q99PV5 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Bhlhe41Q99PV5 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Bhlhe41Q99PV5 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Bhlhe41Q99PV5 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Bhlhe41Q99PV5 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Bhlhe41Q99PV5 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Bhlhe41Q99PV5 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Bhlhe41Q99PV5 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Bhlhe41Q99PV5 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Bhlhe41Q99PV5 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Bhlhe41Q99PV5 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Bhlhe41Q99PV5 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Bhlhe41Q99PV5 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Bhlhe41Q99PV5 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Bhlhe41Q99PV5 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Bhlhe41Q99PV5 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Bhlhe41Q99PV5 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Bhlhe41Q99PV5 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Bhlhe41Q99PV5 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
Bhlhe41Q99PV5 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Bhlhe41Q99PV5 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Bhlhe41Q99PV5 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Bhlhe41Q99PV5 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Bhlhe41Q99PV5 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Bhlhe41Q99PV5 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Bhlhe41Q99PV5 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Bhlhe41Q99PV5 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Bhlhe41Q99PV5 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Bhlhe41Q99PV5 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Bhlhe41Q99PV5 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Bhlhe41Q99PV5 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Bhlhe41Q99PV5 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Bhlhe41Q99PV5 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Bhlhe41Q99PV5 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Bhlhe41Q99PV5 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Bhlhe41Q99PV5 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Bhlhe41Q99PV5 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Bhlhe41Q99PV5 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Bhlhe41Q99PV5 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Bhlhe41Q99PV5 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Bhlhe41Q99PV5 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Bhlhe41Q99PV5 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Bhlhe41Q99PV5 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Bhlhe41Q99PV5 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Bhlhe41Q99PV5 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Bhlhe41Q99PV5 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Bhlhe41Q99PV5 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Bhlhe41Q99PV5 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Bhlhe41Q99PV5 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Bhlhe41Q99PV5 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Bhlhe41Q99PV5 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Bhlhe41Q99PV5 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Bhlhe41Q99PV5 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Bhlhe41Q99PV5 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Bhlhe41Q99PV5 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Bhlhe41Q99PV5 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Bhlhe41Q99PV5 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.7 ms