Protein–RNA interactions for Protein: Q99PE5

Smim3, Small integral membrane protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 60 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim3Q99PE5 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Smim3Q99PE5 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Smim3Q99PE5 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Smim3Q99PE5 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Smim3Q99PE5 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Smim3Q99PE5 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Smim3Q99PE5 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Smim3Q99PE5 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Smim3Q99PE5 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Smim3Q99PE5 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Smim3Q99PE5 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Smim3Q99PE5 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Smim3Q99PE5 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Smim3Q99PE5 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Smim3Q99PE5 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Smim3Q99PE5 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Smim3Q99PE5 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Smim3Q99PE5 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Smim3Q99PE5 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Smim3Q99PE5 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Smim3Q99PE5 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Smim3Q99PE5 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Smim3Q99PE5 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Smim3Q99PE5 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Smim3Q99PE5 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Smim3Q99PE5 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Smim3Q99PE5 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Smim3Q99PE5 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Smim3Q99PE5 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Smim3Q99PE5 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Smim3Q99PE5 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Smim3Q99PE5 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Smim3Q99PE5 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Smim3Q99PE5 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Smim3Q99PE5 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Smim3Q99PE5 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Smim3Q99PE5 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Smim3Q99PE5 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Smim3Q99PE5 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Smim3Q99PE5 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Smim3Q99PE5 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Smim3Q99PE5 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Smim3Q99PE5 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Smim3Q99PE5 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Smim3Q99PE5 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Smim3Q99PE5 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Smim3Q99PE5 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Smim3Q99PE5 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Smim3Q99PE5 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Smim3Q99PE5 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Smim3Q99PE5 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Smim3Q99PE5 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Smim3Q99PE5 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Smim3Q99PE5 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Smim3Q99PE5 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Smim3Q99PE5 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Smim3Q99PE5 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Smim3Q99PE5 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Smim3Q99PE5 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Smim3Q99PE5 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Smim3Q99PE5 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Smim3Q99PE5 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Smim3Q99PE5 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Smim3Q99PE5 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Smim3Q99PE5 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Smim3Q99PE5 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Smim3Q99PE5 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Smim3Q99PE5 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Smim3Q99PE5 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Smim3Q99PE5 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Smim3Q99PE5 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Smim3Q99PE5 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Smim3Q99PE5 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Smim3Q99PE5 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Smim3Q99PE5 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Smim3Q99PE5 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Smim3Q99PE5 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Smim3Q99PE5 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Smim3Q99PE5 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Smim3Q99PE5 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Smim3Q99PE5 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Smim3Q99PE5 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Smim3Q99PE5 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Smim3Q99PE5 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Smim3Q99PE5 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Smim3Q99PE5 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Smim3Q99PE5 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Smim3Q99PE5 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Smim3Q99PE5 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smim3Q99PE5 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smim3Q99PE5 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smim3Q99PE5 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smim3Q99PE5 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smim3Q99PE5 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smim3Q99PE5 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smim3Q99PE5 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smim3Q99PE5 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smim3Q99PE5 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smim3Q99PE5 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smim3Q99PE5 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms