Protein–RNA interactions for Protein: Q99P91

Gpnmb, Transmembrane glycoprotein NMB, mousemouse

Predictions only

Length 574 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GpnmbQ99P91 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GpnmbQ99P91 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GpnmbQ99P91 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GpnmbQ99P91 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GpnmbQ99P91 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GpnmbQ99P91 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GpnmbQ99P91 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GpnmbQ99P91 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GpnmbQ99P91 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GpnmbQ99P91 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
GpnmbQ99P91 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GpnmbQ99P91 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GpnmbQ99P91 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GpnmbQ99P91 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GpnmbQ99P91 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GpnmbQ99P91 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GpnmbQ99P91 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
GpnmbQ99P91 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GpnmbQ99P91 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GpnmbQ99P91 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GpnmbQ99P91 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GpnmbQ99P91 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GpnmbQ99P91 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GpnmbQ99P91 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GpnmbQ99P91 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GpnmbQ99P91 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
GpnmbQ99P91 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GpnmbQ99P91 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GpnmbQ99P91 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GpnmbQ99P91 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GpnmbQ99P91 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GpnmbQ99P91 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GpnmbQ99P91 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GpnmbQ99P91 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GpnmbQ99P91 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GpnmbQ99P91 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GpnmbQ99P91 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GpnmbQ99P91 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GpnmbQ99P91 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GpnmbQ99P91 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GpnmbQ99P91 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GpnmbQ99P91 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GpnmbQ99P91 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GpnmbQ99P91 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GpnmbQ99P91 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GpnmbQ99P91 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GpnmbQ99P91 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GpnmbQ99P91 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
GpnmbQ99P91 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GpnmbQ99P91 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
GpnmbQ99P91 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GpnmbQ99P91 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GpnmbQ99P91 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GpnmbQ99P91 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GpnmbQ99P91 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GpnmbQ99P91 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GpnmbQ99P91 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GpnmbQ99P91 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
GpnmbQ99P91 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
GpnmbQ99P91 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
GpnmbQ99P91 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
GpnmbQ99P91 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
GpnmbQ99P91 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
GpnmbQ99P91 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GpnmbQ99P91 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GpnmbQ99P91 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GpnmbQ99P91 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GpnmbQ99P91 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GpnmbQ99P91 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GpnmbQ99P91 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GpnmbQ99P91 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GpnmbQ99P91 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GpnmbQ99P91 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GpnmbQ99P91 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GpnmbQ99P91 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GpnmbQ99P91 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GpnmbQ99P91 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GpnmbQ99P91 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GpnmbQ99P91 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GpnmbQ99P91 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GpnmbQ99P91 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GpnmbQ99P91 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GpnmbQ99P91 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GpnmbQ99P91 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GpnmbQ99P91 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GpnmbQ99P91 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GpnmbQ99P91 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GpnmbQ99P91 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GpnmbQ99P91 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GpnmbQ99P91 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GpnmbQ99P91 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GpnmbQ99P91 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GpnmbQ99P91 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GpnmbQ99P91 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GpnmbQ99P91 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GpnmbQ99P91 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GpnmbQ99P91 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GpnmbQ99P91 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GpnmbQ99P91 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GpnmbQ99P91 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms