Protein–RNA interactions for Protein: Q99NF2

Nsmf, NMDA receptor synaptonuclear signaling and neuronal migration factor, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NsmfQ99NF2 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
NsmfQ99NF2 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
NsmfQ99NF2 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NsmfQ99NF2 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NsmfQ99NF2 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
NsmfQ99NF2 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NsmfQ99NF2 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NsmfQ99NF2 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NsmfQ99NF2 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NsmfQ99NF2 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NsmfQ99NF2 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
NsmfQ99NF2 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
NsmfQ99NF2 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
NsmfQ99NF2 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
NsmfQ99NF2 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
NsmfQ99NF2 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
NsmfQ99NF2 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
NsmfQ99NF2 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
NsmfQ99NF2 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NsmfQ99NF2 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NsmfQ99NF2 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NsmfQ99NF2 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NsmfQ99NF2 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
NsmfQ99NF2 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NsmfQ99NF2 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
NsmfQ99NF2 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NsmfQ99NF2 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
NsmfQ99NF2 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
NsmfQ99NF2 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NsmfQ99NF2 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NsmfQ99NF2 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NsmfQ99NF2 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NsmfQ99NF2 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NsmfQ99NF2 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NsmfQ99NF2 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NsmfQ99NF2 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NsmfQ99NF2 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
NsmfQ99NF2 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
NsmfQ99NF2 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
NsmfQ99NF2 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
NsmfQ99NF2 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
NsmfQ99NF2 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
NsmfQ99NF2 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
NsmfQ99NF2 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
NsmfQ99NF2 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
NsmfQ99NF2 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
NsmfQ99NF2 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
NsmfQ99NF2 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
NsmfQ99NF2 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
NsmfQ99NF2 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
NsmfQ99NF2 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
NsmfQ99NF2 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
NsmfQ99NF2 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
NsmfQ99NF2 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
NsmfQ99NF2 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
NsmfQ99NF2 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
NsmfQ99NF2 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
NsmfQ99NF2 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
NsmfQ99NF2 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
NsmfQ99NF2 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
NsmfQ99NF2 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
NsmfQ99NF2 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NsmfQ99NF2 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NsmfQ99NF2 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NsmfQ99NF2 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NsmfQ99NF2 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NsmfQ99NF2 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NsmfQ99NF2 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NsmfQ99NF2 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NsmfQ99NF2 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
NsmfQ99NF2 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NsmfQ99NF2 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
NsmfQ99NF2 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
NsmfQ99NF2 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NsmfQ99NF2 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NsmfQ99NF2 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
NsmfQ99NF2 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NsmfQ99NF2 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
NsmfQ99NF2 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
NsmfQ99NF2 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NsmfQ99NF2 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NsmfQ99NF2 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
NsmfQ99NF2 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NsmfQ99NF2 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
NsmfQ99NF2 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NsmfQ99NF2 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NsmfQ99NF2 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NsmfQ99NF2 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NsmfQ99NF2 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
NsmfQ99NF2 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
NsmfQ99NF2 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
NsmfQ99NF2 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
NsmfQ99NF2 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
NsmfQ99NF2 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NsmfQ99NF2 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NsmfQ99NF2 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NsmfQ99NF2 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NsmfQ99NF2 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
NsmfQ99NF2 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
NsmfQ99NF2 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms