Protein–RNA interactions for Protein: Q99NB9

Sf3b1, Splicing factor 3B subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b1Q99NB9 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sf3b1Q99NB9 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sf3b1Q99NB9 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sf3b1Q99NB9 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sf3b1Q99NB9 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sf3b1Q99NB9 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sf3b1Q99NB9 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sf3b1Q99NB9 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sf3b1Q99NB9 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sf3b1Q99NB9 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sf3b1Q99NB9 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sf3b1Q99NB9 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Sf3b1Q99NB9 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Sf3b1Q99NB9 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Sf3b1Q99NB9 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sf3b1Q99NB9 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sf3b1Q99NB9 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sf3b1Q99NB9 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sf3b1Q99NB9 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sf3b1Q99NB9 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sf3b1Q99NB9 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sf3b1Q99NB9 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sf3b1Q99NB9 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sf3b1Q99NB9 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sf3b1Q99NB9 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sf3b1Q99NB9 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sf3b1Q99NB9 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sf3b1Q99NB9 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Sf3b1Q99NB9 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sf3b1Q99NB9 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sf3b1Q99NB9 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sf3b1Q99NB9 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Sf3b1Q99NB9 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sf3b1Q99NB9 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Sf3b1Q99NB9 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Sf3b1Q99NB9 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sf3b1Q99NB9 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sf3b1Q99NB9 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sf3b1Q99NB9 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sf3b1Q99NB9 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sf3b1Q99NB9 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sf3b1Q99NB9 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sf3b1Q99NB9 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sf3b1Q99NB9 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sf3b1Q99NB9 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sf3b1Q99NB9 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sf3b1Q99NB9 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sf3b1Q99NB9 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sf3b1Q99NB9 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sf3b1Q99NB9 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sf3b1Q99NB9 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sf3b1Q99NB9 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sf3b1Q99NB9 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sf3b1Q99NB9 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sf3b1Q99NB9 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sf3b1Q99NB9 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sf3b1Q99NB9 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sf3b1Q99NB9 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sf3b1Q99NB9 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sf3b1Q99NB9 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sf3b1Q99NB9 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sf3b1Q99NB9 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sf3b1Q99NB9 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sf3b1Q99NB9 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sf3b1Q99NB9 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sf3b1Q99NB9 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sf3b1Q99NB9 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sf3b1Q99NB9 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sf3b1Q99NB9 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sf3b1Q99NB9 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sf3b1Q99NB9 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sf3b1Q99NB9 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sf3b1Q99NB9 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sf3b1Q99NB9 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Sf3b1Q99NB9 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sf3b1Q99NB9 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sf3b1Q99NB9 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sf3b1Q99NB9 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sf3b1Q99NB9 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sf3b1Q99NB9 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sf3b1Q99NB9 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sf3b1Q99NB9 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sf3b1Q99NB9 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sf3b1Q99NB9 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sf3b1Q99NB9 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sf3b1Q99NB9 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Sf3b1Q99NB9 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Sf3b1Q99NB9 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sf3b1Q99NB9 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Sf3b1Q99NB9 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sf3b1Q99NB9 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sf3b1Q99NB9 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sf3b1Q99NB9 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sf3b1Q99NB9 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sf3b1Q99NB9 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sf3b1Q99NB9 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sf3b1Q99NB9 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sf3b1Q99NB9 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sf3b1Q99NB9 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sf3b1Q99NB9 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms