Protein–RNA interactions for Protein: Q99NB1

Acss1, Acetyl-coenzyme A synthetase 2-like, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 682 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acss1Q99NB1 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Acss1Q99NB1 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Acss1Q99NB1 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Acss1Q99NB1 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Acss1Q99NB1 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Acss1Q99NB1 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Acss1Q99NB1 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Acss1Q99NB1 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Acss1Q99NB1 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Acss1Q99NB1 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Acss1Q99NB1 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Acss1Q99NB1 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Acss1Q99NB1 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Acss1Q99NB1 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Acss1Q99NB1 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Acss1Q99NB1 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Acss1Q99NB1 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Acss1Q99NB1 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Acss1Q99NB1 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Acss1Q99NB1 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Acss1Q99NB1 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Acss1Q99NB1 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Acss1Q99NB1 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Acss1Q99NB1 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Acss1Q99NB1 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Acss1Q99NB1 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Acss1Q99NB1 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Acss1Q99NB1 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Acss1Q99NB1 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Acss1Q99NB1 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Acss1Q99NB1 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Acss1Q99NB1 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Acss1Q99NB1 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Acss1Q99NB1 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Acss1Q99NB1 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Acss1Q99NB1 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Acss1Q99NB1 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Acss1Q99NB1 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Acss1Q99NB1 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Acss1Q99NB1 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Acss1Q99NB1 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Acss1Q99NB1 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Acss1Q99NB1 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Acss1Q99NB1 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Acss1Q99NB1 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Acss1Q99NB1 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Acss1Q99NB1 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Acss1Q99NB1 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Acss1Q99NB1 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Acss1Q99NB1 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Acss1Q99NB1 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Acss1Q99NB1 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Acss1Q99NB1 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Acss1Q99NB1 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Acss1Q99NB1 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Acss1Q99NB1 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Acss1Q99NB1 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Acss1Q99NB1 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Acss1Q99NB1 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Acss1Q99NB1 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Acss1Q99NB1 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Acss1Q99NB1 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Acss1Q99NB1 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Acss1Q99NB1 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Acss1Q99NB1 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Acss1Q99NB1 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Acss1Q99NB1 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Acss1Q99NB1 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Acss1Q99NB1 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Acss1Q99NB1 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Acss1Q99NB1 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Acss1Q99NB1 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Acss1Q99NB1 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Acss1Q99NB1 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Acss1Q99NB1 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Acss1Q99NB1 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Acss1Q99NB1 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Acss1Q99NB1 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Acss1Q99NB1 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Acss1Q99NB1 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Acss1Q99NB1 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Acss1Q99NB1 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Acss1Q99NB1 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Acss1Q99NB1 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Acss1Q99NB1 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Acss1Q99NB1 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Acss1Q99NB1 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Acss1Q99NB1 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Acss1Q99NB1 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Acss1Q99NB1 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Acss1Q99NB1 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Acss1Q99NB1 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Acss1Q99NB1 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Acss1Q99NB1 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Acss1Q99NB1 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Acss1Q99NB1 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Acss1Q99NB1 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Acss1Q99NB1 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Acss1Q99NB1 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Acss1Q99NB1 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms