Protein–RNA interactions for Protein: Q99NA2

Atoh8, Protein atonal homolog 8, mousemouse

Predictions only

Length 322 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atoh8Q99NA2 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Atoh8Q99NA2 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Atoh8Q99NA2 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Atoh8Q99NA2 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Atoh8Q99NA2 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Atoh8Q99NA2 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Atoh8Q99NA2 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Atoh8Q99NA2 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Atoh8Q99NA2 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Atoh8Q99NA2 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Atoh8Q99NA2 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Atoh8Q99NA2 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Atoh8Q99NA2 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Atoh8Q99NA2 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Atoh8Q99NA2 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Atoh8Q99NA2 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Atoh8Q99NA2 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Atoh8Q99NA2 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Atoh8Q99NA2 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Atoh8Q99NA2 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Atoh8Q99NA2 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Atoh8Q99NA2 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Atoh8Q99NA2 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Atoh8Q99NA2 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Atoh8Q99NA2 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Atoh8Q99NA2 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Atoh8Q99NA2 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Atoh8Q99NA2 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Atoh8Q99NA2 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Atoh8Q99NA2 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Atoh8Q99NA2 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Atoh8Q99NA2 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Atoh8Q99NA2 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Atoh8Q99NA2 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Atoh8Q99NA2 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Atoh8Q99NA2 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Atoh8Q99NA2 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Atoh8Q99NA2 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Atoh8Q99NA2 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Atoh8Q99NA2 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Atoh8Q99NA2 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Atoh8Q99NA2 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Atoh8Q99NA2 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Atoh8Q99NA2 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Atoh8Q99NA2 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Atoh8Q99NA2 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Atoh8Q99NA2 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Atoh8Q99NA2 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Atoh8Q99NA2 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Atoh8Q99NA2 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Atoh8Q99NA2 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Atoh8Q99NA2 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Atoh8Q99NA2 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Atoh8Q99NA2 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Atoh8Q99NA2 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Atoh8Q99NA2 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Atoh8Q99NA2 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Atoh8Q99NA2 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Atoh8Q99NA2 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Atoh8Q99NA2 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Atoh8Q99NA2 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Atoh8Q99NA2 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Atoh8Q99NA2 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Atoh8Q99NA2 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Atoh8Q99NA2 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Atoh8Q99NA2 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Atoh8Q99NA2 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Atoh8Q99NA2 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Atoh8Q99NA2 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Atoh8Q99NA2 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Atoh8Q99NA2 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Atoh8Q99NA2 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Atoh8Q99NA2 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Atoh8Q99NA2 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Atoh8Q99NA2 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Atoh8Q99NA2 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Atoh8Q99NA2 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Atoh8Q99NA2 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Atoh8Q99NA2 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Atoh8Q99NA2 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Atoh8Q99NA2 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Atoh8Q99NA2 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Atoh8Q99NA2 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Atoh8Q99NA2 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Atoh8Q99NA2 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Atoh8Q99NA2 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Atoh8Q99NA2 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Atoh8Q99NA2 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Atoh8Q99NA2 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Atoh8Q99NA2 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Atoh8Q99NA2 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Atoh8Q99NA2 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Atoh8Q99NA2 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Atoh8Q99NA2 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Atoh8Q99NA2 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Atoh8Q99NA2 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Atoh8Q99NA2 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Atoh8Q99NA2 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Atoh8Q99NA2 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Atoh8Q99NA2 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.8 ms