Protein–RNA interactions for Protein: Q99N89

Mrpl43, 39S ribosomal protein L43, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 183 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl43Q99N89 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mrpl43Q99N89 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mrpl43Q99N89 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mrpl43Q99N89 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mrpl43Q99N89 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mrpl43Q99N89 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mrpl43Q99N89 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mrpl43Q99N89 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mrpl43Q99N89 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mrpl43Q99N89 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mrpl43Q99N89 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mrpl43Q99N89 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mrpl43Q99N89 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mrpl43Q99N89 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mrpl43Q99N89 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mrpl43Q99N89 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mrpl43Q99N89 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mrpl43Q99N89 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mrpl43Q99N89 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mrpl43Q99N89 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mrpl43Q99N89 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mrpl43Q99N89 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mrpl43Q99N89 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Mrpl43Q99N89 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mrpl43Q99N89 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mrpl43Q99N89 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mrpl43Q99N89 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mrpl43Q99N89 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mrpl43Q99N89 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mrpl43Q99N89 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mrpl43Q99N89 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mrpl43Q99N89 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mrpl43Q99N89 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Mrpl43Q99N89 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mrpl43Q99N89 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mrpl43Q99N89 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mrpl43Q99N89 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mrpl43Q99N89 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mrpl43Q99N89 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mrpl43Q99N89 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Mrpl43Q99N89 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mrpl43Q99N89 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mrpl43Q99N89 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mrpl43Q99N89 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mrpl43Q99N89 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mrpl43Q99N89 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mrpl43Q99N89 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mrpl43Q99N89 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Mrpl43Q99N89 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mrpl43Q99N89 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mrpl43Q99N89 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mrpl43Q99N89 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mrpl43Q99N89 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mrpl43Q99N89 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mrpl43Q99N89 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mrpl43Q99N89 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mrpl43Q99N89 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mrpl43Q99N89 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mrpl43Q99N89 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mrpl43Q99N89 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mrpl43Q99N89 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Mrpl43Q99N89 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mrpl43Q99N89 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mrpl43Q99N89 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Mrpl43Q99N89 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mrpl43Q99N89 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mrpl43Q99N89 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mrpl43Q99N89 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mrpl43Q99N89 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mrpl43Q99N89 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mrpl43Q99N89 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mrpl43Q99N89 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mrpl43Q99N89 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mrpl43Q99N89 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Mrpl43Q99N89 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Mrpl43Q99N89 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Mrpl43Q99N89 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Mrpl43Q99N89 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Mrpl43Q99N89 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Mrpl43Q99N89 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Mrpl43Q99N89 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mrpl43Q99N89 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mrpl43Q99N89 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mrpl43Q99N89 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mrpl43Q99N89 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mrpl43Q99N89 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Mrpl43Q99N89 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mrpl43Q99N89 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mrpl43Q99N89 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mrpl43Q99N89 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mrpl43Q99N89 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mrpl43Q99N89 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mrpl43Q99N89 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mrpl43Q99N89 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mrpl43Q99N89 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mrpl43Q99N89 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mrpl43Q99N89 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mrpl43Q99N89 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mrpl43Q99N89 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mrpl43Q99N89 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms