Protein–RNA interactions for Protein: Q99MN1

Kars, Lysine--tRNA ligase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 595 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KarsQ99MN1 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KarsQ99MN1 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KarsQ99MN1 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KarsQ99MN1 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KarsQ99MN1 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KarsQ99MN1 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KarsQ99MN1 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KarsQ99MN1 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KarsQ99MN1 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
KarsQ99MN1 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KarsQ99MN1 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KarsQ99MN1 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KarsQ99MN1 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KarsQ99MN1 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KarsQ99MN1 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KarsQ99MN1 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KarsQ99MN1 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KarsQ99MN1 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KarsQ99MN1 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KarsQ99MN1 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KarsQ99MN1 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KarsQ99MN1 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KarsQ99MN1 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
KarsQ99MN1 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
KarsQ99MN1 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
KarsQ99MN1 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KarsQ99MN1 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
KarsQ99MN1 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
KarsQ99MN1 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KarsQ99MN1 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KarsQ99MN1 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
KarsQ99MN1 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
KarsQ99MN1 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
KarsQ99MN1 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KarsQ99MN1 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KarsQ99MN1 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KarsQ99MN1 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KarsQ99MN1 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KarsQ99MN1 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
KarsQ99MN1 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
KarsQ99MN1 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
KarsQ99MN1 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KarsQ99MN1 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KarsQ99MN1 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
KarsQ99MN1 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KarsQ99MN1 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KarsQ99MN1 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KarsQ99MN1 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KarsQ99MN1 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KarsQ99MN1 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KarsQ99MN1 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KarsQ99MN1 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KarsQ99MN1 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KarsQ99MN1 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KarsQ99MN1 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
KarsQ99MN1 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
KarsQ99MN1 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KarsQ99MN1 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KarsQ99MN1 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KarsQ99MN1 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
KarsQ99MN1 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KarsQ99MN1 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
KarsQ99MN1 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
KarsQ99MN1 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
KarsQ99MN1 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
KarsQ99MN1 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
KarsQ99MN1 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC22■■□□□ 1.11
KarsQ99MN1 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
KarsQ99MN1 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
KarsQ99MN1 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
KarsQ99MN1 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KarsQ99MN1 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KarsQ99MN1 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KarsQ99MN1 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KarsQ99MN1 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KarsQ99MN1 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KarsQ99MN1 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KarsQ99MN1 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KarsQ99MN1 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KarsQ99MN1 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KarsQ99MN1 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KarsQ99MN1 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KarsQ99MN1 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KarsQ99MN1 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
KarsQ99MN1 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
KarsQ99MN1 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KarsQ99MN1 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KarsQ99MN1 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KarsQ99MN1 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KarsQ99MN1 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KarsQ99MN1 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KarsQ99MN1 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KarsQ99MN1 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KarsQ99MN1 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KarsQ99MN1 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KarsQ99MN1 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KarsQ99MN1 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KarsQ99MN1 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
KarsQ99MN1 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KarsQ99MN1 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms