Protein–RNA interactions for Protein: Q99MK9

Rassf1, Ras association domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rassf1Q99MK9 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rassf1Q99MK9 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rassf1Q99MK9 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rassf1Q99MK9 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rassf1Q99MK9 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rassf1Q99MK9 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rassf1Q99MK9 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rassf1Q99MK9 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Rassf1Q99MK9 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rassf1Q99MK9 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rassf1Q99MK9 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rassf1Q99MK9 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rassf1Q99MK9 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rassf1Q99MK9 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rassf1Q99MK9 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rassf1Q99MK9 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rassf1Q99MK9 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rassf1Q99MK9 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rassf1Q99MK9 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rassf1Q99MK9 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rassf1Q99MK9 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rassf1Q99MK9 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rassf1Q99MK9 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Rassf1Q99MK9 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rassf1Q99MK9 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rassf1Q99MK9 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rassf1Q99MK9 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rassf1Q99MK9 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rassf1Q99MK9 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Rassf1Q99MK9 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rassf1Q99MK9 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Rassf1Q99MK9 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rassf1Q99MK9 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rassf1Q99MK9 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rassf1Q99MK9 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rassf1Q99MK9 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rassf1Q99MK9 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rassf1Q99MK9 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rassf1Q99MK9 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rassf1Q99MK9 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rassf1Q99MK9 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rassf1Q99MK9 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rassf1Q99MK9 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rassf1Q99MK9 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rassf1Q99MK9 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rassf1Q99MK9 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rassf1Q99MK9 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rassf1Q99MK9 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rassf1Q99MK9 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rassf1Q99MK9 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rassf1Q99MK9 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rassf1Q99MK9 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rassf1Q99MK9 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rassf1Q99MK9 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rassf1Q99MK9 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rassf1Q99MK9 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rassf1Q99MK9 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rassf1Q99MK9 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rassf1Q99MK9 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rassf1Q99MK9 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rassf1Q99MK9 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rassf1Q99MK9 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rassf1Q99MK9 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rassf1Q99MK9 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rassf1Q99MK9 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rassf1Q99MK9 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rassf1Q99MK9 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rassf1Q99MK9 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rassf1Q99MK9 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rassf1Q99MK9 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rassf1Q99MK9 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rassf1Q99MK9 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rassf1Q99MK9 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rassf1Q99MK9 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rassf1Q99MK9 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rassf1Q99MK9 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rassf1Q99MK9 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rassf1Q99MK9 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rassf1Q99MK9 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rassf1Q99MK9 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rassf1Q99MK9 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rassf1Q99MK9 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rassf1Q99MK9 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rassf1Q99MK9 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rassf1Q99MK9 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rassf1Q99MK9 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rassf1Q99MK9 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rassf1Q99MK9 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rassf1Q99MK9 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rassf1Q99MK9 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rassf1Q99MK9 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rassf1Q99MK9 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rassf1Q99MK9 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rassf1Q99MK9 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rassf1Q99MK9 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rassf1Q99MK9 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rassf1Q99MK9 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rassf1Q99MK9 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rassf1Q99MK9 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rassf1Q99MK9 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms