Protein–RNA interactions for Protein: Q99M80

Ptprt, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, mousemouse

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Length 1,454 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprtQ99M80 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PtprtQ99M80 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PtprtQ99M80 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PtprtQ99M80 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PtprtQ99M80 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PtprtQ99M80 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PtprtQ99M80 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PtprtQ99M80 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
PtprtQ99M80 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PtprtQ99M80 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PtprtQ99M80 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PtprtQ99M80 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PtprtQ99M80 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PtprtQ99M80 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PtprtQ99M80 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PtprtQ99M80 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PtprtQ99M80 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PtprtQ99M80 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
PtprtQ99M80 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PtprtQ99M80 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PtprtQ99M80 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PtprtQ99M80 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PtprtQ99M80 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PtprtQ99M80 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PtprtQ99M80 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PtprtQ99M80 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
PtprtQ99M80 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PtprtQ99M80 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PtprtQ99M80 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PtprtQ99M80 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PtprtQ99M80 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PtprtQ99M80 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PtprtQ99M80 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PtprtQ99M80 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PtprtQ99M80 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PtprtQ99M80 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
PtprtQ99M80 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PtprtQ99M80 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PtprtQ99M80 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PtprtQ99M80 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PtprtQ99M80 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PtprtQ99M80 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PtprtQ99M80 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PtprtQ99M80 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PtprtQ99M80 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PtprtQ99M80 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PtprtQ99M80 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PtprtQ99M80 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PtprtQ99M80 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PtprtQ99M80 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PtprtQ99M80 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
PtprtQ99M80 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PtprtQ99M80 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PtprtQ99M80 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PtprtQ99M80 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
PtprtQ99M80 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PtprtQ99M80 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PtprtQ99M80 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
PtprtQ99M80 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PtprtQ99M80 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
PtprtQ99M80 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PtprtQ99M80 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
PtprtQ99M80 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PtprtQ99M80 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PtprtQ99M80 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PtprtQ99M80 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PtprtQ99M80 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PtprtQ99M80 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PtprtQ99M80 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PtprtQ99M80 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PtprtQ99M80 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PtprtQ99M80 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PtprtQ99M80 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PtprtQ99M80 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PtprtQ99M80 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PtprtQ99M80 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PtprtQ99M80 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PtprtQ99M80 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PtprtQ99M80 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
PtprtQ99M80 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PtprtQ99M80 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PtprtQ99M80 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PtprtQ99M80 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PtprtQ99M80 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PtprtQ99M80 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
PtprtQ99M80 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PtprtQ99M80 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
PtprtQ99M80 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PtprtQ99M80 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PtprtQ99M80 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PtprtQ99M80 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PtprtQ99M80 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PtprtQ99M80 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PtprtQ99M80 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PtprtQ99M80 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PtprtQ99M80 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PtprtQ99M80 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
PtprtQ99M80 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PtprtQ99M80 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
PtprtQ99M80 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
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