Protein–RNA interactions for Protein: Q99M54

Cdca3, Cell division cycle-associated protein 3, mousemouse

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Length 266 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdca3Q99M54 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cdca3Q99M54 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cdca3Q99M54 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cdca3Q99M54 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cdca3Q99M54 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cdca3Q99M54 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cdca3Q99M54 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cdca3Q99M54 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cdca3Q99M54 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cdca3Q99M54 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cdca3Q99M54 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cdca3Q99M54 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdca3Q99M54 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdca3Q99M54 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdca3Q99M54 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdca3Q99M54 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdca3Q99M54 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdca3Q99M54 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdca3Q99M54 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdca3Q99M54 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdca3Q99M54 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdca3Q99M54 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdca3Q99M54 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cdca3Q99M54 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cdca3Q99M54 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cdca3Q99M54 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cdca3Q99M54 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cdca3Q99M54 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cdca3Q99M54 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Cdca3Q99M54 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cdca3Q99M54 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Cdca3Q99M54 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Cdca3Q99M54 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Cdca3Q99M54 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Cdca3Q99M54 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cdca3Q99M54 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cdca3Q99M54 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cdca3Q99M54 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cdca3Q99M54 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cdca3Q99M54 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cdca3Q99M54 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cdca3Q99M54 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cdca3Q99M54 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cdca3Q99M54 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cdca3Q99M54 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cdca3Q99M54 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdca3Q99M54 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdca3Q99M54 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdca3Q99M54 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdca3Q99M54 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdca3Q99M54 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdca3Q99M54 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdca3Q99M54 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdca3Q99M54 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdca3Q99M54 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdca3Q99M54 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdca3Q99M54 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdca3Q99M54 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdca3Q99M54 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdca3Q99M54 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdca3Q99M54 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdca3Q99M54 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdca3Q99M54 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdca3Q99M54 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdca3Q99M54 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdca3Q99M54 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdca3Q99M54 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdca3Q99M54 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdca3Q99M54 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdca3Q99M54 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdca3Q99M54 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdca3Q99M54 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdca3Q99M54 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdca3Q99M54 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdca3Q99M54 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdca3Q99M54 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdca3Q99M54 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdca3Q99M54 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdca3Q99M54 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdca3Q99M54 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdca3Q99M54 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdca3Q99M54 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdca3Q99M54 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdca3Q99M54 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdca3Q99M54 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdca3Q99M54 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdca3Q99M54 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdca3Q99M54 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdca3Q99M54 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdca3Q99M54 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdca3Q99M54 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdca3Q99M54 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdca3Q99M54 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdca3Q99M54 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdca3Q99M54 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdca3Q99M54 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdca3Q99M54 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdca3Q99M54 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdca3Q99M54 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdca3Q99M54 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms