Protein–RNA interactions for Protein: Q99LM2

Cdk5rap3, CDK5 regulatory subunit-associated protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk5rap3Q99LM2 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cdk5rap3Q99LM2 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cdk5rap3Q99LM2 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cdk5rap3Q99LM2 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cdk5rap3Q99LM2 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cdk5rap3Q99LM2 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cdk5rap3Q99LM2 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Cdk5rap3Q99LM2 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cdk5rap3Q99LM2 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cdk5rap3Q99LM2 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cdk5rap3Q99LM2 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cdk5rap3Q99LM2 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cdk5rap3Q99LM2 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Cdk5rap3Q99LM2 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cdk5rap3Q99LM2 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cdk5rap3Q99LM2 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cdk5rap3Q99LM2 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cdk5rap3Q99LM2 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cdk5rap3Q99LM2 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cdk5rap3Q99LM2 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cdk5rap3Q99LM2 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cdk5rap3Q99LM2 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cdk5rap3Q99LM2 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cdk5rap3Q99LM2 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cdk5rap3Q99LM2 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cdk5rap3Q99LM2 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cdk5rap3Q99LM2 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Cdk5rap3Q99LM2 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cdk5rap3Q99LM2 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cdk5rap3Q99LM2 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cdk5rap3Q99LM2 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cdk5rap3Q99LM2 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cdk5rap3Q99LM2 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Cdk5rap3Q99LM2 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Cdk5rap3Q99LM2 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cdk5rap3Q99LM2 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cdk5rap3Q99LM2 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cdk5rap3Q99LM2 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cdk5rap3Q99LM2 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cdk5rap3Q99LM2 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cdk5rap3Q99LM2 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cdk5rap3Q99LM2 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cdk5rap3Q99LM2 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cdk5rap3Q99LM2 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cdk5rap3Q99LM2 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cdk5rap3Q99LM2 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cdk5rap3Q99LM2 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cdk5rap3Q99LM2 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cdk5rap3Q99LM2 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Cdk5rap3Q99LM2 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cdk5rap3Q99LM2 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cdk5rap3Q99LM2 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Cdk5rap3Q99LM2 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cdk5rap3Q99LM2 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cdk5rap3Q99LM2 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cdk5rap3Q99LM2 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cdk5rap3Q99LM2 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cdk5rap3Q99LM2 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cdk5rap3Q99LM2 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cdk5rap3Q99LM2 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cdk5rap3Q99LM2 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cdk5rap3Q99LM2 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cdk5rap3Q99LM2 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cdk5rap3Q99LM2 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cdk5rap3Q99LM2 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cdk5rap3Q99LM2 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cdk5rap3Q99LM2 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cdk5rap3Q99LM2 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cdk5rap3Q99LM2 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cdk5rap3Q99LM2 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Cdk5rap3Q99LM2 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cdk5rap3Q99LM2 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cdk5rap3Q99LM2 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cdk5rap3Q99LM2 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cdk5rap3Q99LM2 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cdk5rap3Q99LM2 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cdk5rap3Q99LM2 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Cdk5rap3Q99LM2 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cdk5rap3Q99LM2 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cdk5rap3Q99LM2 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cdk5rap3Q99LM2 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cdk5rap3Q99LM2 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cdk5rap3Q99LM2 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cdk5rap3Q99LM2 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cdk5rap3Q99LM2 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cdk5rap3Q99LM2 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cdk5rap3Q99LM2 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cdk5rap3Q99LM2 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cdk5rap3Q99LM2 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cdk5rap3Q99LM2 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Cdk5rap3Q99LM2 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cdk5rap3Q99LM2 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cdk5rap3Q99LM2 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Cdk5rap3Q99LM2 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cdk5rap3Q99LM2 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cdk5rap3Q99LM2 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cdk5rap3Q99LM2 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cdk5rap3Q99LM2 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cdk5rap3Q99LM2 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cdk5rap3Q99LM2 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms