Protein–RNA interactions for Protein: Q99LE3

Lysmd3, LysM and putative peptidoglycan-binding domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lysmd3Q99LE3 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Lysmd3Q99LE3 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Lysmd3Q99LE3 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Lysmd3Q99LE3 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Lysmd3Q99LE3 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Lysmd3Q99LE3 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Lysmd3Q99LE3 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Lysmd3Q99LE3 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Lysmd3Q99LE3 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Lysmd3Q99LE3 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Lysmd3Q99LE3 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Lysmd3Q99LE3 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Lysmd3Q99LE3 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Lysmd3Q99LE3 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Lysmd3Q99LE3 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Lysmd3Q99LE3 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Lysmd3Q99LE3 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Lysmd3Q99LE3 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Lysmd3Q99LE3 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Lysmd3Q99LE3 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Lysmd3Q99LE3 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Lysmd3Q99LE3 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Lysmd3Q99LE3 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Lysmd3Q99LE3 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Lysmd3Q99LE3 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Lysmd3Q99LE3 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Lysmd3Q99LE3 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Lysmd3Q99LE3 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Lysmd3Q99LE3 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Lysmd3Q99LE3 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Lysmd3Q99LE3 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Lysmd3Q99LE3 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Lysmd3Q99LE3 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Lysmd3Q99LE3 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Lysmd3Q99LE3 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Lysmd3Q99LE3 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Lysmd3Q99LE3 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Lysmd3Q99LE3 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Lysmd3Q99LE3 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Lysmd3Q99LE3 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Lysmd3Q99LE3 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lysmd3Q99LE3 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lysmd3Q99LE3 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lysmd3Q99LE3 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lysmd3Q99LE3 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lysmd3Q99LE3 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lysmd3Q99LE3 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lysmd3Q99LE3 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lysmd3Q99LE3 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lysmd3Q99LE3 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lysmd3Q99LE3 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lysmd3Q99LE3 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lysmd3Q99LE3 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lysmd3Q99LE3 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lysmd3Q99LE3 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lysmd3Q99LE3 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lysmd3Q99LE3 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lysmd3Q99LE3 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lysmd3Q99LE3 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lysmd3Q99LE3 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lysmd3Q99LE3 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lysmd3Q99LE3 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lysmd3Q99LE3 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lysmd3Q99LE3 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lysmd3Q99LE3 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lysmd3Q99LE3 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lysmd3Q99LE3 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lysmd3Q99LE3 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lysmd3Q99LE3 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lysmd3Q99LE3 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Lysmd3Q99LE3 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lysmd3Q99LE3 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Lysmd3Q99LE3 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lysmd3Q99LE3 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lysmd3Q99LE3 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lysmd3Q99LE3 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lysmd3Q99LE3 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lysmd3Q99LE3 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lysmd3Q99LE3 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lysmd3Q99LE3 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lysmd3Q99LE3 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lysmd3Q99LE3 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lysmd3Q99LE3 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lysmd3Q99LE3 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lysmd3Q99LE3 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lysmd3Q99LE3 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lysmd3Q99LE3 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lysmd3Q99LE3 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lysmd3Q99LE3 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lysmd3Q99LE3 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lysmd3Q99LE3 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lysmd3Q99LE3 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lysmd3Q99LE3 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lysmd3Q99LE3 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lysmd3Q99LE3 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lysmd3Q99LE3 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lysmd3Q99LE3 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lysmd3Q99LE3 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lysmd3Q99LE3 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lysmd3Q99LE3 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms