Protein–RNA interactions for Protein: Q99KW3

Triobp, TRIO and F-actin-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 2,014 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TriobpQ99KW3 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TriobpQ99KW3 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TriobpQ99KW3 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TriobpQ99KW3 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TriobpQ99KW3 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TriobpQ99KW3 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TriobpQ99KW3 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TriobpQ99KW3 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TriobpQ99KW3 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TriobpQ99KW3 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TriobpQ99KW3 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TriobpQ99KW3 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
TriobpQ99KW3 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
TriobpQ99KW3 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TriobpQ99KW3 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
TriobpQ99KW3 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
TriobpQ99KW3 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TriobpQ99KW3 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TriobpQ99KW3 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TriobpQ99KW3 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TriobpQ99KW3 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TriobpQ99KW3 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TriobpQ99KW3 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TriobpQ99KW3 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TriobpQ99KW3 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TriobpQ99KW3 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TriobpQ99KW3 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
TriobpQ99KW3 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TriobpQ99KW3 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TriobpQ99KW3 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TriobpQ99KW3 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
TriobpQ99KW3 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TriobpQ99KW3 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TriobpQ99KW3 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TriobpQ99KW3 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
TriobpQ99KW3 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
TriobpQ99KW3 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
TriobpQ99KW3 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
TriobpQ99KW3 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TriobpQ99KW3 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TriobpQ99KW3 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
TriobpQ99KW3 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TriobpQ99KW3 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TriobpQ99KW3 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TriobpQ99KW3 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TriobpQ99KW3 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TriobpQ99KW3 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
TriobpQ99KW3 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TriobpQ99KW3 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TriobpQ99KW3 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TriobpQ99KW3 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TriobpQ99KW3 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TriobpQ99KW3 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TriobpQ99KW3 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TriobpQ99KW3 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TriobpQ99KW3 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TriobpQ99KW3 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TriobpQ99KW3 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
TriobpQ99KW3 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC18■□□□□ 0.47
TriobpQ99KW3 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TriobpQ99KW3 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TriobpQ99KW3 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TriobpQ99KW3 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TriobpQ99KW3 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TriobpQ99KW3 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TriobpQ99KW3 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TriobpQ99KW3 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TriobpQ99KW3 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TriobpQ99KW3 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
TriobpQ99KW3 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TriobpQ99KW3 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TriobpQ99KW3 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
TriobpQ99KW3 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TriobpQ99KW3 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TriobpQ99KW3 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
TriobpQ99KW3 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TriobpQ99KW3 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TriobpQ99KW3 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TriobpQ99KW3 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TriobpQ99KW3 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TriobpQ99KW3 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TriobpQ99KW3 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TriobpQ99KW3 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TriobpQ99KW3 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TriobpQ99KW3 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TriobpQ99KW3 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TriobpQ99KW3 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TriobpQ99KW3 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TriobpQ99KW3 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TriobpQ99KW3 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TriobpQ99KW3 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TriobpQ99KW3 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
TriobpQ99KW3 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TriobpQ99KW3 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TriobpQ99KW3 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TriobpQ99KW3 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TriobpQ99KW3 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TriobpQ99KW3 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TriobpQ99KW3 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TriobpQ99KW3 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms