Protein–RNA interactions for Protein: Q99KU6

Bombesin receptor-activated protein C6orf89 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q99KU6 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Q99KU6 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Q99KU6 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Q99KU6 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Q99KU6 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Q99KU6 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Q99KU6 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Q99KU6 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Q99KU6 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Q99KU6 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Q99KU6 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Q99KU6 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Q99KU6 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Q99KU6 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Q99KU6 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Q99KU6 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Q99KU6 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Q99KU6 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Q99KU6 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Q99KU6 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Q99KU6 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Q99KU6 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Q99KU6 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Q99KU6 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Q99KU6 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Q99KU6 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Q99KU6 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Q99KU6 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Q99KU6 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Q99KU6 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Q99KU6 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Q99KU6 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Q99KU6 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Q99KU6 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Q99KU6 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Q99KU6 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Q99KU6 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Q99KU6 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q99KU6 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q99KU6 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q99KU6 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q99KU6 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q99KU6 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q99KU6 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q99KU6 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q99KU6 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q99KU6 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q99KU6 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q99KU6 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q99KU6 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q99KU6 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q99KU6 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q99KU6 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q99KU6 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q99KU6 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q99KU6 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q99KU6 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q99KU6 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Q99KU6 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q99KU6 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q99KU6 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Q99KU6 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q99KU6 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q99KU6 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q99KU6 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q99KU6 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q99KU6 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q99KU6 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q99KU6 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q99KU6 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q99KU6 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q99KU6 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q99KU6 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q99KU6 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q99KU6 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q99KU6 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q99KU6 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q99KU6 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q99KU6 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q99KU6 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q99KU6 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q99KU6 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q99KU6 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q99KU6 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q99KU6 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q99KU6 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q99KU6 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q99KU6 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q99KU6 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q99KU6 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q99KU6 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q99KU6 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q99KU6 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q99KU6 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q99KU6 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q99KU6 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q99KU6 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q99KU6 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q99KU6 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q99KU6 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms