Protein–RNA interactions for Protein: Q99KP6

Prpf19, Pre-mRNA-processing factor 19, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf19Q99KP6 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Prpf19Q99KP6 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Prpf19Q99KP6 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Prpf19Q99KP6 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Prpf19Q99KP6 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Prpf19Q99KP6 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Prpf19Q99KP6 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Prpf19Q99KP6 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Prpf19Q99KP6 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Prpf19Q99KP6 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
Prpf19Q99KP6 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Prpf19Q99KP6 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Prpf19Q99KP6 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Prpf19Q99KP6 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Prpf19Q99KP6 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Prpf19Q99KP6 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Prpf19Q99KP6 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Prpf19Q99KP6 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Prpf19Q99KP6 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Prpf19Q99KP6 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Prpf19Q99KP6 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Prpf19Q99KP6 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Prpf19Q99KP6 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Prpf19Q99KP6 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Prpf19Q99KP6 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Prpf19Q99KP6 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Prpf19Q99KP6 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Prpf19Q99KP6 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Prpf19Q99KP6 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Prpf19Q99KP6 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Prpf19Q99KP6 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Prpf19Q99KP6 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Prpf19Q99KP6 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Prpf19Q99KP6 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Prpf19Q99KP6 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Prpf19Q99KP6 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Prpf19Q99KP6 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Prpf19Q99KP6 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Prpf19Q99KP6 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Prpf19Q99KP6 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Prpf19Q99KP6 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Prpf19Q99KP6 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Prpf19Q99KP6 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Prpf19Q99KP6 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Prpf19Q99KP6 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Prpf19Q99KP6 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Prpf19Q99KP6 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Prpf19Q99KP6 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Prpf19Q99KP6 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Prpf19Q99KP6 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Prpf19Q99KP6 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Prpf19Q99KP6 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Prpf19Q99KP6 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Prpf19Q99KP6 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Prpf19Q99KP6 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Prpf19Q99KP6 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Prpf19Q99KP6 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Prpf19Q99KP6 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Prpf19Q99KP6 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Prpf19Q99KP6 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Prpf19Q99KP6 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Prpf19Q99KP6 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Prpf19Q99KP6 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Prpf19Q99KP6 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Prpf19Q99KP6 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Prpf19Q99KP6 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Prpf19Q99KP6 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Prpf19Q99KP6 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Prpf19Q99KP6 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Prpf19Q99KP6 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Prpf19Q99KP6 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Prpf19Q99KP6 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Prpf19Q99KP6 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Prpf19Q99KP6 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Prpf19Q99KP6 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Prpf19Q99KP6 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Prpf19Q99KP6 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Prpf19Q99KP6 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Prpf19Q99KP6 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Prpf19Q99KP6 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Prpf19Q99KP6 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Prpf19Q99KP6 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Prpf19Q99KP6 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Prpf19Q99KP6 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Prpf19Q99KP6 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Prpf19Q99KP6 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Prpf19Q99KP6 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Prpf19Q99KP6 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Prpf19Q99KP6 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Prpf19Q99KP6 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Prpf19Q99KP6 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Prpf19Q99KP6 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Prpf19Q99KP6 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Prpf19Q99KP6 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Prpf19Q99KP6 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Prpf19Q99KP6 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Prpf19Q99KP6 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Prpf19Q99KP6 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Prpf19Q99KP6 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Prpf19Q99KP6 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms