Protein–RNA interactions for Protein: Q99JY6

Higd1b, HIG1 domain family member 1B, mousemouse

Predictions only

Length 98 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Higd1bQ99JY6 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Higd1bQ99JY6 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Higd1bQ99JY6 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Higd1bQ99JY6 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Higd1bQ99JY6 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Higd1bQ99JY6 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Higd1bQ99JY6 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Higd1bQ99JY6 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Higd1bQ99JY6 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Higd1bQ99JY6 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Higd1bQ99JY6 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Higd1bQ99JY6 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Higd1bQ99JY6 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Higd1bQ99JY6 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Higd1bQ99JY6 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Higd1bQ99JY6 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Higd1bQ99JY6 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Higd1bQ99JY6 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Higd1bQ99JY6 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Higd1bQ99JY6 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Higd1bQ99JY6 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Higd1bQ99JY6 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Higd1bQ99JY6 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Higd1bQ99JY6 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Higd1bQ99JY6 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Higd1bQ99JY6 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Higd1bQ99JY6 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Higd1bQ99JY6 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Higd1bQ99JY6 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Higd1bQ99JY6 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Higd1bQ99JY6 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Higd1bQ99JY6 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Higd1bQ99JY6 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Higd1bQ99JY6 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Higd1bQ99JY6 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Higd1bQ99JY6 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Higd1bQ99JY6 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Higd1bQ99JY6 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Higd1bQ99JY6 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Higd1bQ99JY6 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Higd1bQ99JY6 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Higd1bQ99JY6 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Higd1bQ99JY6 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Higd1bQ99JY6 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Higd1bQ99JY6 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Higd1bQ99JY6 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Higd1bQ99JY6 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Higd1bQ99JY6 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Higd1bQ99JY6 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Higd1bQ99JY6 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Higd1bQ99JY6 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Higd1bQ99JY6 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Higd1bQ99JY6 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Higd1bQ99JY6 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Higd1bQ99JY6 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Higd1bQ99JY6 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Higd1bQ99JY6 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Higd1bQ99JY6 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Higd1bQ99JY6 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Higd1bQ99JY6 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Higd1bQ99JY6 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Higd1bQ99JY6 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Higd1bQ99JY6 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Higd1bQ99JY6 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Higd1bQ99JY6 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Higd1bQ99JY6 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Higd1bQ99JY6 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Higd1bQ99JY6 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Higd1bQ99JY6 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Higd1bQ99JY6 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Higd1bQ99JY6 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Higd1bQ99JY6 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Higd1bQ99JY6 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Higd1bQ99JY6 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Higd1bQ99JY6 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Higd1bQ99JY6 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Higd1bQ99JY6 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Higd1bQ99JY6 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Higd1bQ99JY6 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Higd1bQ99JY6 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Higd1bQ99JY6 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Higd1bQ99JY6 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Higd1bQ99JY6 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Higd1bQ99JY6 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Higd1bQ99JY6 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Higd1bQ99JY6 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Higd1bQ99JY6 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Higd1bQ99JY6 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Higd1bQ99JY6 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Higd1bQ99JY6 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Higd1bQ99JY6 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Higd1bQ99JY6 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Higd1bQ99JY6 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Higd1bQ99JY6 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Higd1bQ99JY6 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Higd1bQ99JY6 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Higd1bQ99JY6 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Higd1bQ99JY6 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Higd1bQ99JY6 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Higd1bQ99JY6 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms