Protein–RNA interactions for Protein: Q99JW4

Lims1, LIM and senescent cell antigen-like-containing domain protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lims1Q99JW4 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lims1Q99JW4 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lims1Q99JW4 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lims1Q99JW4 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lims1Q99JW4 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lims1Q99JW4 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lims1Q99JW4 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lims1Q99JW4 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lims1Q99JW4 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Lims1Q99JW4 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lims1Q99JW4 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lims1Q99JW4 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lims1Q99JW4 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lims1Q99JW4 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Lims1Q99JW4 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lims1Q99JW4 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lims1Q99JW4 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lims1Q99JW4 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lims1Q99JW4 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lims1Q99JW4 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lims1Q99JW4 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lims1Q99JW4 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lims1Q99JW4 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lims1Q99JW4 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lims1Q99JW4 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lims1Q99JW4 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lims1Q99JW4 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lims1Q99JW4 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lims1Q99JW4 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lims1Q99JW4 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lims1Q99JW4 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lims1Q99JW4 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lims1Q99JW4 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lims1Q99JW4 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Lims1Q99JW4 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Lims1Q99JW4 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lims1Q99JW4 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lims1Q99JW4 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lims1Q99JW4 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lims1Q99JW4 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lims1Q99JW4 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lims1Q99JW4 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lims1Q99JW4 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lims1Q99JW4 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lims1Q99JW4 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lims1Q99JW4 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lims1Q99JW4 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Lims1Q99JW4 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lims1Q99JW4 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lims1Q99JW4 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lims1Q99JW4 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Lims1Q99JW4 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lims1Q99JW4 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lims1Q99JW4 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Lims1Q99JW4 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lims1Q99JW4 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lims1Q99JW4 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lims1Q99JW4 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lims1Q99JW4 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lims1Q99JW4 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lims1Q99JW4 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lims1Q99JW4 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Lims1Q99JW4 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lims1Q99JW4 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lims1Q99JW4 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lims1Q99JW4 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lims1Q99JW4 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lims1Q99JW4 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lims1Q99JW4 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lims1Q99JW4 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lims1Q99JW4 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lims1Q99JW4 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lims1Q99JW4 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lims1Q99JW4 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lims1Q99JW4 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lims1Q99JW4 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lims1Q99JW4 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lims1Q99JW4 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lims1Q99JW4 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lims1Q99JW4 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lims1Q99JW4 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lims1Q99JW4 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lims1Q99JW4 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lims1Q99JW4 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lims1Q99JW4 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lims1Q99JW4 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lims1Q99JW4 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lims1Q99JW4 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lims1Q99JW4 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lims1Q99JW4 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Lims1Q99JW4 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Lims1Q99JW4 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lims1Q99JW4 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lims1Q99JW4 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lims1Q99JW4 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lims1Q99JW4 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lims1Q99JW4 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lims1Q99JW4 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lims1Q99JW4 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lims1Q99JW4 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.8 ms