Protein–RNA interactions for Protein: Q99JT6

Tlcd1, Calfacilitin, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlcd1Q99JT6 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Tlcd1Q99JT6 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Tlcd1Q99JT6 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Tlcd1Q99JT6 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Tlcd1Q99JT6 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Tlcd1Q99JT6 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Tlcd1Q99JT6 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Tlcd1Q99JT6 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Tlcd1Q99JT6 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Tlcd1Q99JT6 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Tlcd1Q99JT6 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Tlcd1Q99JT6 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Tlcd1Q99JT6 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Tlcd1Q99JT6 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Tlcd1Q99JT6 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Tlcd1Q99JT6 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Tlcd1Q99JT6 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Tlcd1Q99JT6 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Tlcd1Q99JT6 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Tlcd1Q99JT6 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Tlcd1Q99JT6 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Tlcd1Q99JT6 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Tlcd1Q99JT6 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Tlcd1Q99JT6 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Tlcd1Q99JT6 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Tlcd1Q99JT6 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Tlcd1Q99JT6 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Tlcd1Q99JT6 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Tlcd1Q99JT6 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Tlcd1Q99JT6 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Tlcd1Q99JT6 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Tlcd1Q99JT6 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Tlcd1Q99JT6 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Tlcd1Q99JT6 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Tlcd1Q99JT6 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Tlcd1Q99JT6 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Tlcd1Q99JT6 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Tlcd1Q99JT6 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Tlcd1Q99JT6 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Tlcd1Q99JT6 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Tlcd1Q99JT6 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Tlcd1Q99JT6 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Tlcd1Q99JT6 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Tlcd1Q99JT6 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Tlcd1Q99JT6 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Tlcd1Q99JT6 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Tlcd1Q99JT6 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Tlcd1Q99JT6 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Tlcd1Q99JT6 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Tlcd1Q99JT6 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Tlcd1Q99JT6 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Tlcd1Q99JT6 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Tlcd1Q99JT6 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Tlcd1Q99JT6 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Tlcd1Q99JT6 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Tlcd1Q99JT6 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Tlcd1Q99JT6 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Tlcd1Q99JT6 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Tlcd1Q99JT6 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Tlcd1Q99JT6 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Tlcd1Q99JT6 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Tlcd1Q99JT6 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Tlcd1Q99JT6 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Tlcd1Q99JT6 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Tlcd1Q99JT6 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Tlcd1Q99JT6 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Tlcd1Q99JT6 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Tlcd1Q99JT6 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Tlcd1Q99JT6 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Tlcd1Q99JT6 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Tlcd1Q99JT6 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Tlcd1Q99JT6 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Tlcd1Q99JT6 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Tlcd1Q99JT6 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tlcd1Q99JT6 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tlcd1Q99JT6 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tlcd1Q99JT6 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tlcd1Q99JT6 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tlcd1Q99JT6 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tlcd1Q99JT6 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tlcd1Q99JT6 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tlcd1Q99JT6 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tlcd1Q99JT6 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tlcd1Q99JT6 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tlcd1Q99JT6 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tlcd1Q99JT6 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tlcd1Q99JT6 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tlcd1Q99JT6 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tlcd1Q99JT6 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tlcd1Q99JT6 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tlcd1Q99JT6 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tlcd1Q99JT6 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tlcd1Q99JT6 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tlcd1Q99JT6 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tlcd1Q99JT6 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tlcd1Q99JT6 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tlcd1Q99JT6 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tlcd1Q99JT6 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tlcd1Q99JT6 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tlcd1Q99JT6 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.2 ms