Protein–RNA interactions for Protein: Q99JH8

Kdelr1, ER lumen protein-retaining receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdelr1Q99JH8 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Kdelr1Q99JH8 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Kdelr1Q99JH8 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Kdelr1Q99JH8 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Kdelr1Q99JH8 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Kdelr1Q99JH8 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Kdelr1Q99JH8 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Kdelr1Q99JH8 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Kdelr1Q99JH8 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Kdelr1Q99JH8 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Kdelr1Q99JH8 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Kdelr1Q99JH8 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Kdelr1Q99JH8 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Kdelr1Q99JH8 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Kdelr1Q99JH8 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Kdelr1Q99JH8 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Kdelr1Q99JH8 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Kdelr1Q99JH8 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Kdelr1Q99JH8 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Kdelr1Q99JH8 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Kdelr1Q99JH8 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Kdelr1Q99JH8 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Kdelr1Q99JH8 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Kdelr1Q99JH8 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Kdelr1Q99JH8 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Kdelr1Q99JH8 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Kdelr1Q99JH8 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Kdelr1Q99JH8 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Kdelr1Q99JH8 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Kdelr1Q99JH8 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Kdelr1Q99JH8 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Kdelr1Q99JH8 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Kdelr1Q99JH8 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Kdelr1Q99JH8 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Kdelr1Q99JH8 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Kdelr1Q99JH8 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Kdelr1Q99JH8 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Kdelr1Q99JH8 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Kdelr1Q99JH8 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Kdelr1Q99JH8 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Kdelr1Q99JH8 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Kdelr1Q99JH8 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Kdelr1Q99JH8 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Kdelr1Q99JH8 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Kdelr1Q99JH8 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Kdelr1Q99JH8 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Kdelr1Q99JH8 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Kdelr1Q99JH8 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Kdelr1Q99JH8 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Kdelr1Q99JH8 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Kdelr1Q99JH8 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Kdelr1Q99JH8 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Kdelr1Q99JH8 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Kdelr1Q99JH8 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Kdelr1Q99JH8 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Kdelr1Q99JH8 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Kdelr1Q99JH8 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Kdelr1Q99JH8 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Kdelr1Q99JH8 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Kdelr1Q99JH8 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Kdelr1Q99JH8 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Kdelr1Q99JH8 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Kdelr1Q99JH8 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Kdelr1Q99JH8 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Kdelr1Q99JH8 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Kdelr1Q99JH8 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Kdelr1Q99JH8 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Kdelr1Q99JH8 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Kdelr1Q99JH8 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Kdelr1Q99JH8 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Kdelr1Q99JH8 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Kdelr1Q99JH8 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Kdelr1Q99JH8 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Kdelr1Q99JH8 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Kdelr1Q99JH8 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Kdelr1Q99JH8 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Kdelr1Q99JH8 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Kdelr1Q99JH8 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Kdelr1Q99JH8 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Kdelr1Q99JH8 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Kdelr1Q99JH8 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Kdelr1Q99JH8 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Kdelr1Q99JH8 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Kdelr1Q99JH8 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Kdelr1Q99JH8 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Kdelr1Q99JH8 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Kdelr1Q99JH8 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Kdelr1Q99JH8 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Kdelr1Q99JH8 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Kdelr1Q99JH8 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Kdelr1Q99JH8 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Kdelr1Q99JH8 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Kdelr1Q99JH8 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Kdelr1Q99JH8 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Kdelr1Q99JH8 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Kdelr1Q99JH8 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Kdelr1Q99JH8 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Kdelr1Q99JH8 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Kdelr1Q99JH8 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Kdelr1Q99JH8 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms