Protein–RNA interactions for Protein: Q99J72

Apobec3, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec3Q99J72 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Apobec3Q99J72 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Apobec3Q99J72 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Apobec3Q99J72 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Apobec3Q99J72 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Apobec3Q99J72 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
Apobec3Q99J72 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Apobec3Q99J72 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Apobec3Q99J72 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Apobec3Q99J72 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Apobec3Q99J72 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
Apobec3Q99J72 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Apobec3Q99J72 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Apobec3Q99J72 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Apobec3Q99J72 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Apobec3Q99J72 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Apobec3Q99J72 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Apobec3Q99J72 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Apobec3Q99J72 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Apobec3Q99J72 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Apobec3Q99J72 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Apobec3Q99J72 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Apobec3Q99J72 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Apobec3Q99J72 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Apobec3Q99J72 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Apobec3Q99J72 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Apobec3Q99J72 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
Apobec3Q99J72 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Apobec3Q99J72 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Apobec3Q99J72 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Apobec3Q99J72 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Apobec3Q99J72 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Apobec3Q99J72 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Apobec3Q99J72 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.7
Apobec3Q99J72 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Apobec3Q99J72 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Apobec3Q99J72 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
Apobec3Q99J72 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
Apobec3Q99J72 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
Apobec3Q99J72 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Apobec3Q99J72 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Apobec3Q99J72 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Apobec3Q99J72 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
Apobec3Q99J72 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
Apobec3Q99J72 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Apobec3Q99J72 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
Apobec3Q99J72 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Apobec3Q99J72 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Apobec3Q99J72 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Apobec3Q99J72 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Apobec3Q99J72 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Apobec3Q99J72 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Apobec3Q99J72 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Apobec3Q99J72 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Apobec3Q99J72 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Apobec3Q99J72 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Apobec3Q99J72 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Apobec3Q99J72 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
Apobec3Q99J72 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Apobec3Q99J72 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Apobec3Q99J72 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Apobec3Q99J72 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Apobec3Q99J72 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Apobec3Q99J72 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
Apobec3Q99J72 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Apobec3Q99J72 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Apobec3Q99J72 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Apobec3Q99J72 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Apobec3Q99J72 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Apobec3Q99J72 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Apobec3Q99J72 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Apobec3Q99J72 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Apobec3Q99J72 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Apobec3Q99J72 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Apobec3Q99J72 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Apobec3Q99J72 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Apobec3Q99J72 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Apobec3Q99J72 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Apobec3Q99J72 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Apobec3Q99J72 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Apobec3Q99J72 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Apobec3Q99J72 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Apobec3Q99J72 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Apobec3Q99J72 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Apobec3Q99J72 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Apobec3Q99J72 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Apobec3Q99J72 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Apobec3Q99J72 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Apobec3Q99J72 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Apobec3Q99J72 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Apobec3Q99J72 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Apobec3Q99J72 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Apobec3Q99J72 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Apobec3Q99J72 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Apobec3Q99J72 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Apobec3Q99J72 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Apobec3Q99J72 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Apobec3Q99J72 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Apobec3Q99J72 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Apobec3Q99J72 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms