Protein–RNA interactions for Protein: Q925N2

Sfxn2, Sideroflexin-2, mousemouse

Predictions only

Length 322 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfxn2Q925N2 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sfxn2Q925N2 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sfxn2Q925N2 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sfxn2Q925N2 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sfxn2Q925N2 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sfxn2Q925N2 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sfxn2Q925N2 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sfxn2Q925N2 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sfxn2Q925N2 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sfxn2Q925N2 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sfxn2Q925N2 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sfxn2Q925N2 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sfxn2Q925N2 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sfxn2Q925N2 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sfxn2Q925N2 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sfxn2Q925N2 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sfxn2Q925N2 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sfxn2Q925N2 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sfxn2Q925N2 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sfxn2Q925N2 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sfxn2Q925N2 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sfxn2Q925N2 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Sfxn2Q925N2 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Sfxn2Q925N2 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Sfxn2Q925N2 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sfxn2Q925N2 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sfxn2Q925N2 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sfxn2Q925N2 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sfxn2Q925N2 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sfxn2Q925N2 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sfxn2Q925N2 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sfxn2Q925N2 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sfxn2Q925N2 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sfxn2Q925N2 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sfxn2Q925N2 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sfxn2Q925N2 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sfxn2Q925N2 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sfxn2Q925N2 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sfxn2Q925N2 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sfxn2Q925N2 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sfxn2Q925N2 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sfxn2Q925N2 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sfxn2Q925N2 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sfxn2Q925N2 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sfxn2Q925N2 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sfxn2Q925N2 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sfxn2Q925N2 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sfxn2Q925N2 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sfxn2Q925N2 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sfxn2Q925N2 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sfxn2Q925N2 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sfxn2Q925N2 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sfxn2Q925N2 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sfxn2Q925N2 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sfxn2Q925N2 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sfxn2Q925N2 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sfxn2Q925N2 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sfxn2Q925N2 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sfxn2Q925N2 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sfxn2Q925N2 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Sfxn2Q925N2 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sfxn2Q925N2 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sfxn2Q925N2 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sfxn2Q925N2 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Sfxn2Q925N2 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Sfxn2Q925N2 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sfxn2Q925N2 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Sfxn2Q925N2 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sfxn2Q925N2 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Sfxn2Q925N2 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sfxn2Q925N2 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sfxn2Q925N2 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sfxn2Q925N2 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sfxn2Q925N2 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sfxn2Q925N2 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sfxn2Q925N2 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sfxn2Q925N2 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sfxn2Q925N2 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sfxn2Q925N2 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sfxn2Q925N2 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sfxn2Q925N2 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sfxn2Q925N2 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sfxn2Q925N2 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sfxn2Q925N2 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sfxn2Q925N2 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sfxn2Q925N2 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sfxn2Q925N2 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Sfxn2Q925N2 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sfxn2Q925N2 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sfxn2Q925N2 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sfxn2Q925N2 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sfxn2Q925N2 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sfxn2Q925N2 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Sfxn2Q925N2 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sfxn2Q925N2 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sfxn2Q925N2 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sfxn2Q925N2 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sfxn2Q925N2 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sfxn2Q925N2 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sfxn2Q925N2 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87.6 ms