Protein–RNA interactions for Protein: Q925F3

Rnf144a, E3 ubiquitin-protein ligase RNF144A, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf144aQ925F3 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rnf144aQ925F3 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rnf144aQ925F3 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Rnf144aQ925F3 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rnf144aQ925F3 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rnf144aQ925F3 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Rnf144aQ925F3 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Rnf144aQ925F3 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Rnf144aQ925F3 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rnf144aQ925F3 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Rnf144aQ925F3 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Rnf144aQ925F3 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rnf144aQ925F3 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rnf144aQ925F3 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rnf144aQ925F3 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rnf144aQ925F3 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rnf144aQ925F3 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rnf144aQ925F3 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rnf144aQ925F3 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rnf144aQ925F3 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rnf144aQ925F3 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rnf144aQ925F3 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rnf144aQ925F3 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rnf144aQ925F3 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rnf144aQ925F3 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rnf144aQ925F3 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rnf144aQ925F3 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rnf144aQ925F3 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rnf144aQ925F3 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rnf144aQ925F3 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rnf144aQ925F3 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rnf144aQ925F3 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rnf144aQ925F3 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rnf144aQ925F3 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Rnf144aQ925F3 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rnf144aQ925F3 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Rnf144aQ925F3 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rnf144aQ925F3 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rnf144aQ925F3 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rnf144aQ925F3 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rnf144aQ925F3 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rnf144aQ925F3 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rnf144aQ925F3 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rnf144aQ925F3 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rnf144aQ925F3 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rnf144aQ925F3 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rnf144aQ925F3 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rnf144aQ925F3 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rnf144aQ925F3 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rnf144aQ925F3 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rnf144aQ925F3 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rnf144aQ925F3 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rnf144aQ925F3 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rnf144aQ925F3 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rnf144aQ925F3 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rnf144aQ925F3 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Rnf144aQ925F3 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rnf144aQ925F3 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rnf144aQ925F3 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rnf144aQ925F3 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rnf144aQ925F3 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rnf144aQ925F3 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rnf144aQ925F3 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rnf144aQ925F3 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rnf144aQ925F3 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rnf144aQ925F3 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rnf144aQ925F3 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rnf144aQ925F3 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Rnf144aQ925F3 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Rnf144aQ925F3 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rnf144aQ925F3 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rnf144aQ925F3 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rnf144aQ925F3 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rnf144aQ925F3 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rnf144aQ925F3 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rnf144aQ925F3 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rnf144aQ925F3 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rnf144aQ925F3 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rnf144aQ925F3 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rnf144aQ925F3 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Rnf144aQ925F3 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rnf144aQ925F3 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rnf144aQ925F3 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rnf144aQ925F3 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rnf144aQ925F3 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rnf144aQ925F3 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rnf144aQ925F3 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rnf144aQ925F3 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rnf144aQ925F3 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rnf144aQ925F3 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rnf144aQ925F3 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rnf144aQ925F3 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rnf144aQ925F3 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rnf144aQ925F3 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rnf144aQ925F3 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rnf144aQ925F3 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rnf144aQ925F3 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rnf144aQ925F3 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rnf144aQ925F3 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rnf144aQ925F3 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms