Protein–RNA interactions for Protein: Q924L1

Letmd1, LETM1 domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 360 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Letmd1Q924L1 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Letmd1Q924L1 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Letmd1Q924L1 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Letmd1Q924L1 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Letmd1Q924L1 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Letmd1Q924L1 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Letmd1Q924L1 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Letmd1Q924L1 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Letmd1Q924L1 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Letmd1Q924L1 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Letmd1Q924L1 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Letmd1Q924L1 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Letmd1Q924L1 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Letmd1Q924L1 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Letmd1Q924L1 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Letmd1Q924L1 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Letmd1Q924L1 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Letmd1Q924L1 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Letmd1Q924L1 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Letmd1Q924L1 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Letmd1Q924L1 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Letmd1Q924L1 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Letmd1Q924L1 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Letmd1Q924L1 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Letmd1Q924L1 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Letmd1Q924L1 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Letmd1Q924L1 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Letmd1Q924L1 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Letmd1Q924L1 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Letmd1Q924L1 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Letmd1Q924L1 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Letmd1Q924L1 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Letmd1Q924L1 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Letmd1Q924L1 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Letmd1Q924L1 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Letmd1Q924L1 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Letmd1Q924L1 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Letmd1Q924L1 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Letmd1Q924L1 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Letmd1Q924L1 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Letmd1Q924L1 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Letmd1Q924L1 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Letmd1Q924L1 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Letmd1Q924L1 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Letmd1Q924L1 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Letmd1Q924L1 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Letmd1Q924L1 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Letmd1Q924L1 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Letmd1Q924L1 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Letmd1Q924L1 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Letmd1Q924L1 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Letmd1Q924L1 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Letmd1Q924L1 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Letmd1Q924L1 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Letmd1Q924L1 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Letmd1Q924L1 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Letmd1Q924L1 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Letmd1Q924L1 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Letmd1Q924L1 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Letmd1Q924L1 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Letmd1Q924L1 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Letmd1Q924L1 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Letmd1Q924L1 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Letmd1Q924L1 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Letmd1Q924L1 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Letmd1Q924L1 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Letmd1Q924L1 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Letmd1Q924L1 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Letmd1Q924L1 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Letmd1Q924L1 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Letmd1Q924L1 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Letmd1Q924L1 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Letmd1Q924L1 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Letmd1Q924L1 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Letmd1Q924L1 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Letmd1Q924L1 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Letmd1Q924L1 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Letmd1Q924L1 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Letmd1Q924L1 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Letmd1Q924L1 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Letmd1Q924L1 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Letmd1Q924L1 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Letmd1Q924L1 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Letmd1Q924L1 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Letmd1Q924L1 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Letmd1Q924L1 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Letmd1Q924L1 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Letmd1Q924L1 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Letmd1Q924L1 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Letmd1Q924L1 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Letmd1Q924L1 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Letmd1Q924L1 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Letmd1Q924L1 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Letmd1Q924L1 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Letmd1Q924L1 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Letmd1Q924L1 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Letmd1Q924L1 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Letmd1Q924L1 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Letmd1Q924L1 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Letmd1Q924L1 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.2 ms