Protein–RNA interactions for Protein: Q923L3

Csmd1, CUB and sushi domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 3,564 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csmd1Q923L3 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Csmd1Q923L3 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Csmd1Q923L3 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Csmd1Q923L3 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Csmd1Q923L3 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Csmd1Q923L3 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Csmd1Q923L3 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Csmd1Q923L3 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Csmd1Q923L3 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Csmd1Q923L3 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Csmd1Q923L3 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Csmd1Q923L3 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Csmd1Q923L3 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Csmd1Q923L3 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Csmd1Q923L3 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Csmd1Q923L3 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Csmd1Q923L3 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Csmd1Q923L3 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Csmd1Q923L3 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Csmd1Q923L3 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Csmd1Q923L3 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Csmd1Q923L3 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Csmd1Q923L3 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Csmd1Q923L3 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Csmd1Q923L3 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Csmd1Q923L3 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Csmd1Q923L3 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Csmd1Q923L3 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Csmd1Q923L3 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Csmd1Q923L3 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Csmd1Q923L3 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Csmd1Q923L3 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Csmd1Q923L3 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Csmd1Q923L3 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Csmd1Q923L3 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Csmd1Q923L3 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Csmd1Q923L3 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Csmd1Q923L3 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Csmd1Q923L3 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Csmd1Q923L3 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Csmd1Q923L3 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Csmd1Q923L3 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Csmd1Q923L3 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Csmd1Q923L3 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Csmd1Q923L3 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Csmd1Q923L3 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Csmd1Q923L3 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Csmd1Q923L3 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Csmd1Q923L3 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Csmd1Q923L3 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Csmd1Q923L3 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Csmd1Q923L3 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Csmd1Q923L3 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Csmd1Q923L3 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Csmd1Q923L3 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Csmd1Q923L3 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Csmd1Q923L3 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Csmd1Q923L3 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Csmd1Q923L3 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Csmd1Q923L3 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Csmd1Q923L3 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Csmd1Q923L3 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Csmd1Q923L3 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Csmd1Q923L3 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Csmd1Q923L3 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Csmd1Q923L3 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Csmd1Q923L3 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Csmd1Q923L3 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Csmd1Q923L3 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Csmd1Q923L3 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Csmd1Q923L3 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Csmd1Q923L3 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Csmd1Q923L3 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Csmd1Q923L3 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Csmd1Q923L3 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Csmd1Q923L3 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Csmd1Q923L3 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Csmd1Q923L3 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Csmd1Q923L3 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Csmd1Q923L3 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Csmd1Q923L3 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Csmd1Q923L3 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Csmd1Q923L3 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Csmd1Q923L3 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Csmd1Q923L3 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Csmd1Q923L3 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Csmd1Q923L3 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Csmd1Q923L3 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Csmd1Q923L3 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Csmd1Q923L3 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Csmd1Q923L3 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Csmd1Q923L3 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Csmd1Q923L3 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Csmd1Q923L3 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Csmd1Q923L3 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Csmd1Q923L3 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Csmd1Q923L3 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Csmd1Q923L3 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Csmd1Q923L3 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Csmd1Q923L3 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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