Protein–RNA interactions for Protein: Q922F4

Tubb6, Tubulin beta-6 chain, mousemouse

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb6Q922F4 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tubb6Q922F4 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tubb6Q922F4 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tubb6Q922F4 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tubb6Q922F4 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tubb6Q922F4 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tubb6Q922F4 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tubb6Q922F4 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tubb6Q922F4 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Tubb6Q922F4 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tubb6Q922F4 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tubb6Q922F4 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tubb6Q922F4 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Tubb6Q922F4 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Tubb6Q922F4 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tubb6Q922F4 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tubb6Q922F4 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tubb6Q922F4 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tubb6Q922F4 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Tubb6Q922F4 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tubb6Q922F4 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tubb6Q922F4 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tubb6Q922F4 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tubb6Q922F4 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tubb6Q922F4 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tubb6Q922F4 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tubb6Q922F4 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tubb6Q922F4 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tubb6Q922F4 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tubb6Q922F4 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tubb6Q922F4 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tubb6Q922F4 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tubb6Q922F4 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tubb6Q922F4 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tubb6Q922F4 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tubb6Q922F4 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tubb6Q922F4 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tubb6Q922F4 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tubb6Q922F4 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tubb6Q922F4 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Tubb6Q922F4 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Tubb6Q922F4 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Tubb6Q922F4 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Tubb6Q922F4 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tubb6Q922F4 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tubb6Q922F4 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tubb6Q922F4 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tubb6Q922F4 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tubb6Q922F4 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tubb6Q922F4 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tubb6Q922F4 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tubb6Q922F4 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tubb6Q922F4 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tubb6Q922F4 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tubb6Q922F4 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Tubb6Q922F4 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tubb6Q922F4 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tubb6Q922F4 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tubb6Q922F4 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tubb6Q922F4 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tubb6Q922F4 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tubb6Q922F4 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tubb6Q922F4 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tubb6Q922F4 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tubb6Q922F4 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tubb6Q922F4 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tubb6Q922F4 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tubb6Q922F4 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tubb6Q922F4 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tubb6Q922F4 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tubb6Q922F4 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tubb6Q922F4 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Tubb6Q922F4 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tubb6Q922F4 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tubb6Q922F4 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tubb6Q922F4 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tubb6Q922F4 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tubb6Q922F4 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tubb6Q922F4 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tubb6Q922F4 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tubb6Q922F4 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tubb6Q922F4 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tubb6Q922F4 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tubb6Q922F4 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tubb6Q922F4 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tubb6Q922F4 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tubb6Q922F4 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Tubb6Q922F4 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tubb6Q922F4 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tubb6Q922F4 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Tubb6Q922F4 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tubb6Q922F4 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tubb6Q922F4 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tubb6Q922F4 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Tubb6Q922F4 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tubb6Q922F4 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tubb6Q922F4 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tubb6Q922F4 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tubb6Q922F4 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tubb6Q922F4 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.1 ms