Protein–RNA interactions for Protein: Q920A7

Afg3l1, AFG3-like protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 789 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Afg3l1Q920A7 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Afg3l1Q920A7 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Afg3l1Q920A7 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Afg3l1Q920A7 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Afg3l1Q920A7 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Afg3l1Q920A7 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Afg3l1Q920A7 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Afg3l1Q920A7 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Afg3l1Q920A7 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Afg3l1Q920A7 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Afg3l1Q920A7 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Afg3l1Q920A7 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Afg3l1Q920A7 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Afg3l1Q920A7 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Afg3l1Q920A7 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Afg3l1Q920A7 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Afg3l1Q920A7 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Afg3l1Q920A7 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Afg3l1Q920A7 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Afg3l1Q920A7 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Afg3l1Q920A7 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Afg3l1Q920A7 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Afg3l1Q920A7 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Afg3l1Q920A7 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Afg3l1Q920A7 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Afg3l1Q920A7 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Afg3l1Q920A7 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Afg3l1Q920A7 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Afg3l1Q920A7 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Afg3l1Q920A7 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Afg3l1Q920A7 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Afg3l1Q920A7 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Afg3l1Q920A7 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Afg3l1Q920A7 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Afg3l1Q920A7 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Afg3l1Q920A7 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Afg3l1Q920A7 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Afg3l1Q920A7 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Afg3l1Q920A7 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Afg3l1Q920A7 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Afg3l1Q920A7 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Afg3l1Q920A7 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Afg3l1Q920A7 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Afg3l1Q920A7 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Afg3l1Q920A7 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Afg3l1Q920A7 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Afg3l1Q920A7 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Afg3l1Q920A7 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Afg3l1Q920A7 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Afg3l1Q920A7 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Afg3l1Q920A7 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Afg3l1Q920A7 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Afg3l1Q920A7 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Afg3l1Q920A7 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Afg3l1Q920A7 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Afg3l1Q920A7 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Afg3l1Q920A7 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
Afg3l1Q920A7 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Afg3l1Q920A7 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Afg3l1Q920A7 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Afg3l1Q920A7 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Afg3l1Q920A7 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Afg3l1Q920A7 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Afg3l1Q920A7 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Afg3l1Q920A7 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Afg3l1Q920A7 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Afg3l1Q920A7 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Afg3l1Q920A7 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Afg3l1Q920A7 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Afg3l1Q920A7 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Afg3l1Q920A7 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Afg3l1Q920A7 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Afg3l1Q920A7 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Afg3l1Q920A7 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Afg3l1Q920A7 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Afg3l1Q920A7 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Afg3l1Q920A7 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Afg3l1Q920A7 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Afg3l1Q920A7 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Afg3l1Q920A7 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Afg3l1Q920A7 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Afg3l1Q920A7 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Afg3l1Q920A7 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Afg3l1Q920A7 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Afg3l1Q920A7 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Afg3l1Q920A7 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Afg3l1Q920A7 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Afg3l1Q920A7 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Afg3l1Q920A7 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Afg3l1Q920A7 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Afg3l1Q920A7 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Afg3l1Q920A7 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Afg3l1Q920A7 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Afg3l1Q920A7 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Afg3l1Q920A7 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Afg3l1Q920A7 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Afg3l1Q920A7 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Afg3l1Q920A7 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Afg3l1Q920A7 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Afg3l1Q920A7 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.2 ms