Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZW3

Smarca5, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A member 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,051 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarca5Q91ZW3 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Smarca5Q91ZW3 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Smarca5Q91ZW3 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Smarca5Q91ZW3 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Smarca5Q91ZW3 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Smarca5Q91ZW3 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Smarca5Q91ZW3 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Smarca5Q91ZW3 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Smarca5Q91ZW3 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Smarca5Q91ZW3 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Smarca5Q91ZW3 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Smarca5Q91ZW3 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Smarca5Q91ZW3 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Smarca5Q91ZW3 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Smarca5Q91ZW3 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Smarca5Q91ZW3 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Smarca5Q91ZW3 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Smarca5Q91ZW3 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Smarca5Q91ZW3 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Smarca5Q91ZW3 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Smarca5Q91ZW3 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Smarca5Q91ZW3 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Smarca5Q91ZW3 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Smarca5Q91ZW3 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Smarca5Q91ZW3 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Smarca5Q91ZW3 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Smarca5Q91ZW3 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Smarca5Q91ZW3 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Smarca5Q91ZW3 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Smarca5Q91ZW3 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Smarca5Q91ZW3 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Smarca5Q91ZW3 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Smarca5Q91ZW3 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Smarca5Q91ZW3 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Smarca5Q91ZW3 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Smarca5Q91ZW3 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Smarca5Q91ZW3 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Smarca5Q91ZW3 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Smarca5Q91ZW3 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Smarca5Q91ZW3 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Smarca5Q91ZW3 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Smarca5Q91ZW3 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Smarca5Q91ZW3 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Smarca5Q91ZW3 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Smarca5Q91ZW3 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Smarca5Q91ZW3 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Smarca5Q91ZW3 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Smarca5Q91ZW3 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Smarca5Q91ZW3 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Smarca5Q91ZW3 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Smarca5Q91ZW3 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Smarca5Q91ZW3 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Smarca5Q91ZW3 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Smarca5Q91ZW3 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Smarca5Q91ZW3 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Smarca5Q91ZW3 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Smarca5Q91ZW3 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Smarca5Q91ZW3 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Smarca5Q91ZW3 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Smarca5Q91ZW3 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Smarca5Q91ZW3 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Smarca5Q91ZW3 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Smarca5Q91ZW3 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Smarca5Q91ZW3 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Smarca5Q91ZW3 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Smarca5Q91ZW3 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Smarca5Q91ZW3 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Smarca5Q91ZW3 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Smarca5Q91ZW3 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Smarca5Q91ZW3 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Smarca5Q91ZW3 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Smarca5Q91ZW3 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Smarca5Q91ZW3 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Smarca5Q91ZW3 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Smarca5Q91ZW3 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Smarca5Q91ZW3 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Smarca5Q91ZW3 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Smarca5Q91ZW3 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Smarca5Q91ZW3 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Smarca5Q91ZW3 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Smarca5Q91ZW3 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Smarca5Q91ZW3 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Smarca5Q91ZW3 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Smarca5Q91ZW3 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Smarca5Q91ZW3 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Smarca5Q91ZW3 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Smarca5Q91ZW3 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Smarca5Q91ZW3 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Smarca5Q91ZW3 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Smarca5Q91ZW3 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Smarca5Q91ZW3 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Smarca5Q91ZW3 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Smarca5Q91ZW3 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Smarca5Q91ZW3 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Smarca5Q91ZW3 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Smarca5Q91ZW3 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Smarca5Q91ZW3 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Smarca5Q91ZW3 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Smarca5Q91ZW3 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Smarca5Q91ZW3 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.4 ms