Protein–RNA interactions for Protein: Q91YE8

Synpo2, Synaptopodin-2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,087 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Synpo2Q91YE8 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Synpo2Q91YE8 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Synpo2Q91YE8 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Synpo2Q91YE8 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Synpo2Q91YE8 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Synpo2Q91YE8 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Synpo2Q91YE8 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Synpo2Q91YE8 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Synpo2Q91YE8 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Synpo2Q91YE8 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Synpo2Q91YE8 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Synpo2Q91YE8 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Synpo2Q91YE8 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Synpo2Q91YE8 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Synpo2Q91YE8 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Synpo2Q91YE8 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Synpo2Q91YE8 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Synpo2Q91YE8 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Synpo2Q91YE8 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Synpo2Q91YE8 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Synpo2Q91YE8 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Synpo2Q91YE8 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Synpo2Q91YE8 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Synpo2Q91YE8 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Synpo2Q91YE8 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Synpo2Q91YE8 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Synpo2Q91YE8 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Synpo2Q91YE8 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Synpo2Q91YE8 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Synpo2Q91YE8 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Synpo2Q91YE8 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Synpo2Q91YE8 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Synpo2Q91YE8 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Synpo2Q91YE8 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Synpo2Q91YE8 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Synpo2Q91YE8 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Synpo2Q91YE8 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Synpo2Q91YE8 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Synpo2Q91YE8 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Synpo2Q91YE8 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Synpo2Q91YE8 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Synpo2Q91YE8 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Synpo2Q91YE8 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Synpo2Q91YE8 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Synpo2Q91YE8 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Synpo2Q91YE8 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Synpo2Q91YE8 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Synpo2Q91YE8 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Synpo2Q91YE8 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Synpo2Q91YE8 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Synpo2Q91YE8 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Synpo2Q91YE8 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Synpo2Q91YE8 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Synpo2Q91YE8 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Synpo2Q91YE8 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Synpo2Q91YE8 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Synpo2Q91YE8 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Synpo2Q91YE8 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Synpo2Q91YE8 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Synpo2Q91YE8 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Synpo2Q91YE8 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Synpo2Q91YE8 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Synpo2Q91YE8 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Synpo2Q91YE8 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Synpo2Q91YE8 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Synpo2Q91YE8 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Synpo2Q91YE8 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Synpo2Q91YE8 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Synpo2Q91YE8 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Synpo2Q91YE8 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Synpo2Q91YE8 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Synpo2Q91YE8 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Synpo2Q91YE8 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Synpo2Q91YE8 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Synpo2Q91YE8 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Synpo2Q91YE8 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Synpo2Q91YE8 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Synpo2Q91YE8 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Synpo2Q91YE8 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Synpo2Q91YE8 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Synpo2Q91YE8 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Synpo2Q91YE8 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Synpo2Q91YE8 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Synpo2Q91YE8 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Synpo2Q91YE8 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Synpo2Q91YE8 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Synpo2Q91YE8 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Synpo2Q91YE8 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Synpo2Q91YE8 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Synpo2Q91YE8 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Synpo2Q91YE8 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Synpo2Q91YE8 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Synpo2Q91YE8 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Synpo2Q91YE8 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Synpo2Q91YE8 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Synpo2Q91YE8 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Synpo2Q91YE8 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Synpo2Q91YE8 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Synpo2Q91YE8 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Synpo2Q91YE8 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.9 ms