Protein–RNA interactions for Protein: Q91XE9

Creb3l3, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 3-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 479 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Creb3l3Q91XE9 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Creb3l3Q91XE9 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Creb3l3Q91XE9 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Creb3l3Q91XE9 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Creb3l3Q91XE9 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Creb3l3Q91XE9 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Creb3l3Q91XE9 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Creb3l3Q91XE9 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Creb3l3Q91XE9 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Creb3l3Q91XE9 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Creb3l3Q91XE9 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Creb3l3Q91XE9 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Creb3l3Q91XE9 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Creb3l3Q91XE9 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Creb3l3Q91XE9 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Creb3l3Q91XE9 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Creb3l3Q91XE9 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Creb3l3Q91XE9 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Creb3l3Q91XE9 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Creb3l3Q91XE9 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Creb3l3Q91XE9 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Creb3l3Q91XE9 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Creb3l3Q91XE9 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Creb3l3Q91XE9 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Creb3l3Q91XE9 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Creb3l3Q91XE9 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Creb3l3Q91XE9 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Creb3l3Q91XE9 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Creb3l3Q91XE9 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Creb3l3Q91XE9 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Creb3l3Q91XE9 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Creb3l3Q91XE9 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Creb3l3Q91XE9 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Creb3l3Q91XE9 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Creb3l3Q91XE9 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Creb3l3Q91XE9 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Creb3l3Q91XE9 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Creb3l3Q91XE9 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Creb3l3Q91XE9 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Creb3l3Q91XE9 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Creb3l3Q91XE9 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Creb3l3Q91XE9 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Creb3l3Q91XE9 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Creb3l3Q91XE9 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Creb3l3Q91XE9 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Creb3l3Q91XE9 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Creb3l3Q91XE9 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Creb3l3Q91XE9 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Creb3l3Q91XE9 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Creb3l3Q91XE9 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Creb3l3Q91XE9 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Creb3l3Q91XE9 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Creb3l3Q91XE9 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Creb3l3Q91XE9 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Creb3l3Q91XE9 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Creb3l3Q91XE9 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Creb3l3Q91XE9 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Creb3l3Q91XE9 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Creb3l3Q91XE9 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Creb3l3Q91XE9 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Creb3l3Q91XE9 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Creb3l3Q91XE9 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Creb3l3Q91XE9 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Creb3l3Q91XE9 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Creb3l3Q91XE9 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Creb3l3Q91XE9 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Creb3l3Q91XE9 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Creb3l3Q91XE9 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Creb3l3Q91XE9 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Creb3l3Q91XE9 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Creb3l3Q91XE9 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Creb3l3Q91XE9 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Creb3l3Q91XE9 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Creb3l3Q91XE9 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Creb3l3Q91XE9 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Creb3l3Q91XE9 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Creb3l3Q91XE9 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Creb3l3Q91XE9 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Creb3l3Q91XE9 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Creb3l3Q91XE9 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Creb3l3Q91XE9 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Creb3l3Q91XE9 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Creb3l3Q91XE9 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Creb3l3Q91XE9 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Creb3l3Q91XE9 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Creb3l3Q91XE9 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Creb3l3Q91XE9 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Creb3l3Q91XE9 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Creb3l3Q91XE9 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Creb3l3Q91XE9 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Creb3l3Q91XE9 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Creb3l3Q91XE9 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Creb3l3Q91XE9 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Creb3l3Q91XE9 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Creb3l3Q91XE9 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Creb3l3Q91XE9 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Creb3l3Q91XE9 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Creb3l3Q91XE9 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Creb3l3Q91XE9 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Creb3l3Q91XE9 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms