Protein–RNA interactions for Protein: Q91WC0

Setd3, Histone-lysine N-methyltransferase setd3, mousemouse

Predictions only

Length 594 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Setd3Q91WC0 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Setd3Q91WC0 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Setd3Q91WC0 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Setd3Q91WC0 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Setd3Q91WC0 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Setd3Q91WC0 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Setd3Q91WC0 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Setd3Q91WC0 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Setd3Q91WC0 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Setd3Q91WC0 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Setd3Q91WC0 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Setd3Q91WC0 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Setd3Q91WC0 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Setd3Q91WC0 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Setd3Q91WC0 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Setd3Q91WC0 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Setd3Q91WC0 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Setd3Q91WC0 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Setd3Q91WC0 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Setd3Q91WC0 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Setd3Q91WC0 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Setd3Q91WC0 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Setd3Q91WC0 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Setd3Q91WC0 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Setd3Q91WC0 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Setd3Q91WC0 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Setd3Q91WC0 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Setd3Q91WC0 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Setd3Q91WC0 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Setd3Q91WC0 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Setd3Q91WC0 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Setd3Q91WC0 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Setd3Q91WC0 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Setd3Q91WC0 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Setd3Q91WC0 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Setd3Q91WC0 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Setd3Q91WC0 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
Setd3Q91WC0 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Setd3Q91WC0 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
Setd3Q91WC0 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Setd3Q91WC0 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Setd3Q91WC0 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Setd3Q91WC0 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Setd3Q91WC0 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Setd3Q91WC0 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Setd3Q91WC0 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Setd3Q91WC0 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Setd3Q91WC0 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Setd3Q91WC0 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Setd3Q91WC0 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Setd3Q91WC0 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Setd3Q91WC0 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Setd3Q91WC0 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Setd3Q91WC0 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Setd3Q91WC0 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Setd3Q91WC0 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Setd3Q91WC0 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Setd3Q91WC0 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Setd3Q91WC0 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Setd3Q91WC0 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Setd3Q91WC0 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Setd3Q91WC0 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Setd3Q91WC0 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Setd3Q91WC0 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Setd3Q91WC0 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Setd3Q91WC0 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Setd3Q91WC0 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Setd3Q91WC0 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Setd3Q91WC0 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Setd3Q91WC0 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Setd3Q91WC0 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Setd3Q91WC0 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Setd3Q91WC0 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Setd3Q91WC0 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Setd3Q91WC0 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Setd3Q91WC0 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Setd3Q91WC0 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Setd3Q91WC0 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Setd3Q91WC0 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Setd3Q91WC0 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Setd3Q91WC0 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Setd3Q91WC0 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Setd3Q91WC0 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Setd3Q91WC0 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Setd3Q91WC0 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Setd3Q91WC0 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Setd3Q91WC0 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Setd3Q91WC0 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Setd3Q91WC0 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Setd3Q91WC0 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Setd3Q91WC0 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Setd3Q91WC0 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Setd3Q91WC0 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Setd3Q91WC0 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Setd3Q91WC0 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Setd3Q91WC0 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Setd3Q91WC0 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Setd3Q91WC0 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Setd3Q91WC0 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Setd3Q91WC0 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms