Protein–RNA interactions for Protein: Q91W78

Usb1, U6 snRNA phosphodiesterase, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usb1Q91W78 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Usb1Q91W78 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Usb1Q91W78 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Usb1Q91W78 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Usb1Q91W78 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Usb1Q91W78 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Usb1Q91W78 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Usb1Q91W78 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Usb1Q91W78 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Usb1Q91W78 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Usb1Q91W78 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Usb1Q91W78 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Usb1Q91W78 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Usb1Q91W78 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Usb1Q91W78 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Usb1Q91W78 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Usb1Q91W78 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Usb1Q91W78 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Usb1Q91W78 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Usb1Q91W78 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Usb1Q91W78 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Usb1Q91W78 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Usb1Q91W78 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Usb1Q91W78 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Usb1Q91W78 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Usb1Q91W78 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Usb1Q91W78 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Usb1Q91W78 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Usb1Q91W78 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Usb1Q91W78 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Usb1Q91W78 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Usb1Q91W78 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Usb1Q91W78 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Usb1Q91W78 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Usb1Q91W78 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Usb1Q91W78 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Usb1Q91W78 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Usb1Q91W78 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Usb1Q91W78 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Usb1Q91W78 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Usb1Q91W78 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Usb1Q91W78 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Usb1Q91W78 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Usb1Q91W78 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Usb1Q91W78 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Usb1Q91W78 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Usb1Q91W78 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Usb1Q91W78 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Usb1Q91W78 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Usb1Q91W78 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Usb1Q91W78 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Usb1Q91W78 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Usb1Q91W78 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Usb1Q91W78 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Usb1Q91W78 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Usb1Q91W78 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Usb1Q91W78 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Usb1Q91W78 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Usb1Q91W78 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Usb1Q91W78 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Usb1Q91W78 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Usb1Q91W78 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Usb1Q91W78 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Usb1Q91W78 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Usb1Q91W78 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Usb1Q91W78 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Usb1Q91W78 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Usb1Q91W78 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Usb1Q91W78 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Usb1Q91W78 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Usb1Q91W78 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Usb1Q91W78 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Usb1Q91W78 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Usb1Q91W78 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Usb1Q91W78 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Usb1Q91W78 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Usb1Q91W78 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Usb1Q91W78 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Usb1Q91W78 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Usb1Q91W78 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Usb1Q91W78 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Usb1Q91W78 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Usb1Q91W78 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Usb1Q91W78 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Usb1Q91W78 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Usb1Q91W78 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Usb1Q91W78 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Usb1Q91W78 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Usb1Q91W78 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Usb1Q91W78 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Usb1Q91W78 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Usb1Q91W78 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Usb1Q91W78 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Usb1Q91W78 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Usb1Q91W78 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Usb1Q91W78 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Usb1Q91W78 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Usb1Q91W78 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Usb1Q91W78 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Usb1Q91W78 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms