Protein–RNA interactions for Protein: Q91V80

Apof, Apolipoprotein F, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ApofQ91V80 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ApofQ91V80 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ApofQ91V80 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ApofQ91V80 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ApofQ91V80 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ApofQ91V80 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ApofQ91V80 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ApofQ91V80 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ApofQ91V80 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ApofQ91V80 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ApofQ91V80 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
ApofQ91V80 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ApofQ91V80 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ApofQ91V80 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ApofQ91V80 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ApofQ91V80 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ApofQ91V80 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ApofQ91V80 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ApofQ91V80 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ApofQ91V80 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ApofQ91V80 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ApofQ91V80 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ApofQ91V80 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ApofQ91V80 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ApofQ91V80 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ApofQ91V80 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ApofQ91V80 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
ApofQ91V80 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ApofQ91V80 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ApofQ91V80 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ApofQ91V80 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ApofQ91V80 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ApofQ91V80 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ApofQ91V80 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ApofQ91V80 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ApofQ91V80 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ApofQ91V80 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ApofQ91V80 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ApofQ91V80 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ApofQ91V80 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ApofQ91V80 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ApofQ91V80 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ApofQ91V80 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ApofQ91V80 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ApofQ91V80 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ApofQ91V80 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ApofQ91V80 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ApofQ91V80 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ApofQ91V80 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ApofQ91V80 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ApofQ91V80 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ApofQ91V80 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ApofQ91V80 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ApofQ91V80 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ApofQ91V80 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ApofQ91V80 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ApofQ91V80 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ApofQ91V80 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ApofQ91V80 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ApofQ91V80 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ApofQ91V80 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
ApofQ91V80 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ApofQ91V80 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ApofQ91V80 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.33
ApofQ91V80 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
ApofQ91V80 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ApofQ91V80 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ApofQ91V80 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ApofQ91V80 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ApofQ91V80 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ApofQ91V80 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
ApofQ91V80 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ApofQ91V80 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ApofQ91V80 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ApofQ91V80 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ApofQ91V80 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ApofQ91V80 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ApofQ91V80 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ApofQ91V80 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ApofQ91V80 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ApofQ91V80 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ApofQ91V80 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ApofQ91V80 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ApofQ91V80 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ApofQ91V80 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ApofQ91V80 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ApofQ91V80 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
ApofQ91V80 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ApofQ91V80 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ApofQ91V80 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ApofQ91V80 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ApofQ91V80 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ApofQ91V80 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ApofQ91V80 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ApofQ91V80 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ApofQ91V80 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ApofQ91V80 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
ApofQ91V80 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ApofQ91V80 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ApofQ91V80 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms