Protein–RNA interactions for Protein: Q8VI88

Odf4, Outer dense fiber protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Odf4Q8VI88 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Odf4Q8VI88 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Odf4Q8VI88 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Odf4Q8VI88 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Odf4Q8VI88 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Odf4Q8VI88 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Odf4Q8VI88 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Odf4Q8VI88 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Odf4Q8VI88 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Odf4Q8VI88 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Odf4Q8VI88 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Odf4Q8VI88 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Odf4Q8VI88 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Odf4Q8VI88 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Odf4Q8VI88 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Odf4Q8VI88 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Odf4Q8VI88 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Odf4Q8VI88 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Odf4Q8VI88 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Odf4Q8VI88 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Odf4Q8VI88 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Odf4Q8VI88 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Odf4Q8VI88 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Odf4Q8VI88 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Odf4Q8VI88 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Odf4Q8VI88 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Odf4Q8VI88 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Odf4Q8VI88 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Odf4Q8VI88 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Odf4Q8VI88 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Odf4Q8VI88 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Odf4Q8VI88 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Odf4Q8VI88 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Odf4Q8VI88 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Odf4Q8VI88 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Odf4Q8VI88 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Odf4Q8VI88 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Odf4Q8VI88 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Odf4Q8VI88 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Odf4Q8VI88 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Odf4Q8VI88 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Odf4Q8VI88 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Odf4Q8VI88 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Odf4Q8VI88 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Odf4Q8VI88 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Odf4Q8VI88 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Odf4Q8VI88 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Odf4Q8VI88 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Odf4Q8VI88 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Odf4Q8VI88 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Odf4Q8VI88 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Odf4Q8VI88 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Odf4Q8VI88 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Odf4Q8VI88 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Odf4Q8VI88 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Odf4Q8VI88 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Odf4Q8VI88 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Odf4Q8VI88 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Odf4Q8VI88 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Odf4Q8VI88 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Odf4Q8VI88 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Odf4Q8VI88 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Odf4Q8VI88 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Odf4Q8VI88 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Odf4Q8VI88 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Odf4Q8VI88 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Odf4Q8VI88 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Odf4Q8VI88 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Odf4Q8VI88 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Odf4Q8VI88 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Odf4Q8VI88 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Odf4Q8VI88 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Odf4Q8VI88 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Odf4Q8VI88 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Odf4Q8VI88 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Odf4Q8VI88 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Odf4Q8VI88 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Odf4Q8VI88 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Odf4Q8VI88 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Odf4Q8VI88 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Odf4Q8VI88 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Odf4Q8VI88 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Odf4Q8VI88 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Odf4Q8VI88 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Odf4Q8VI88 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Odf4Q8VI88 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Odf4Q8VI88 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Odf4Q8VI88 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Odf4Q8VI88 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Odf4Q8VI88 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Odf4Q8VI88 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Odf4Q8VI88 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Odf4Q8VI88 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Odf4Q8VI88 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Odf4Q8VI88 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Odf4Q8VI88 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Odf4Q8VI88 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Odf4Q8VI88 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Odf4Q8VI88 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Odf4Q8VI88 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms